Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Vps8Q0P5W1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Vps8Q0P5W1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Vps8Q0P5W1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Vps8Q0P5W1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
Vps8Q0P5W1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
Vps8Q0P5W1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
Vps8Q0P5W1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Vps8Q0P5W1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Vps8Q0P5W1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
Vps8Q0P5W1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
Vps8Q0P5W1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Vps8Q0P5W1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Vps8Q0P5W1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Vps8Q0P5W1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Vps8Q0P5W1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Vps8Q0P5W1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Vps8Q0P5W1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Vps8Q0P5W1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Vps8Q0P5W1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Vps8Q0P5W1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Vps8Q0P5W1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Vps8Q0P5W1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Vps8Q0P5W1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Vps8Q0P5W1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Vps8Q0P5W1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
Vps8Q0P5W1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
Vps8Q0P5W1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Vps8Q0P5W1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Vps8Q0P5W1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Vps8Q0P5W1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Vps8Q0P5W1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
Vps8Q0P5W1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Vps8Q0P5W1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Vps8Q0P5W1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Vps8Q0P5W1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
Vps8Q0P5W1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Vps8Q0P5W1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
Vps8Q0P5W1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Vps8Q0P5W1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Vps8Q0P5W1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Vps8Q0P5W1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
Vps8Q0P5W1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Vps8Q0P5W1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Vps8Q0P5W1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Vps8Q0P5W1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Vps8Q0P5W1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Vps8Q0P5W1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Vps8Q0P5W1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Vps8Q0P5W1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
Vps8Q0P5W1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Vps8Q0P5W1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Vps8Q0P5W1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Vps8Q0P5W1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Vps8Q0P5W1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Vps8Q0P5W1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
Vps8Q0P5W1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Vps8Q0P5W1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Vps8Q0P5W1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Vps8Q0P5W1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Vps8Q0P5W1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Vps8Q0P5W1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Vps8Q0P5W1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Vps8Q0P5W1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Vps8Q0P5W1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Vps8Q0P5W1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Vps8Q0P5W1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40.37■■■■■ 4.05
Vps8Q0P5W1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
Vps8Q0P5W1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Vps8Q0P5W1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Vps8Q0P5W1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Vps8Q0P5W1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Vps8Q0P5W1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Vps8Q0P5W1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Vps8Q0P5W1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Vps8Q0P5W1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Vps8Q0P5W1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Vps8Q0P5W1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Vps8Q0P5W1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Vps8Q0P5W1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Vps8Q0P5W1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Vps8Q0P5W1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Vps8Q0P5W1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Vps8Q0P5W1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Vps8Q0P5W1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Vps8Q0P5W1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Vps8Q0P5W1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Vps8Q0P5W1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Vps8Q0P5W1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Vps8Q0P5W1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Vps8Q0P5W1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Vps8Q0P5W1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Vps8Q0P5W1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Vps8Q0P5W1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
Vps8Q0P5W1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Vps8Q0P5W1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
Vps8Q0P5W1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
Vps8Q0P5W1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Vps8Q0P5W1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Vps8Q0P5W1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 238.7 ms