Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Kcnma1Q08460 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Kcnma1Q08460 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kcnma1Q08460 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Kcnma1Q08460 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Kcnma1Q08460 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Kcnma1Q08460 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Kcnma1Q08460 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Kcnma1Q08460 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Kcnma1Q08460 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Kcnma1Q08460 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Kcnma1Q08460 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Kcnma1Q08460 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Kcnma1Q08460 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Kcnma1Q08460 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Kcnma1Q08460 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Kcnma1Q08460 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Kcnma1Q08460 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Kcnma1Q08460 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kcnma1Q08460 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Kcnma1Q08460 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Kcnma1Q08460 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Kcnma1Q08460 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Kcnma1Q08460 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Kcnma1Q08460 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Kcnma1Q08460 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Kcnma1Q08460 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Kcnma1Q08460 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Kcnma1Q08460 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Kcnma1Q08460 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Kcnma1Q08460 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Kcnma1Q08460 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Kcnma1Q08460 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kcnma1Q08460 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Kcnma1Q08460 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Kcnma1Q08460 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Kcnma1Q08460 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Kcnma1Q08460 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Kcnma1Q08460 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kcnma1Q08460 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kcnma1Q08460 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kcnma1Q08460 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kcnma1Q08460 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kcnma1Q08460 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Kcnma1Q08460 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Kcnma1Q08460 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kcnma1Q08460 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kcnma1Q08460 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Kcnma1Q08460 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Kcnma1Q08460 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Kcnma1Q08460 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Kcnma1Q08460 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Kcnma1Q08460 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Kcnma1Q08460 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Kcnma1Q08460 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kcnma1Q08460 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Kcnma1Q08460 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Kcnma1Q08460 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Kcnma1Q08460 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Kcnma1Q08460 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kcnma1Q08460 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kcnma1Q08460 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kcnma1Q08460 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Kcnma1Q08460 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kcnma1Q08460 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kcnma1Q08460 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kcnma1Q08460 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Kcnma1Q08460 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Kcnma1Q08460 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kcnma1Q08460 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kcnma1Q08460 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kcnma1Q08460 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kcnma1Q08460 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kcnma1Q08460 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Kcnma1Q08460 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kcnma1Q08460 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kcnma1Q08460 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kcnma1Q08460 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kcnma1Q08460 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kcnma1Q08460 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kcnma1Q08460 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kcnma1Q08460 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kcnma1Q08460 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kcnma1Q08460 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kcnma1Q08460 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kcnma1Q08460 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kcnma1Q08460 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kcnma1Q08460 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kcnma1Q08460 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Kcnma1Q08460 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kcnma1Q08460 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kcnma1Q08460 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kcnma1Q08460 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kcnma1Q08460 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kcnma1Q08460 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kcnma1Q08460 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Kcnma1Q08460 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kcnma1Q08460 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kcnma1Q08460 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kcnma1Q08460 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms