Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Calb2Q08331 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Calb2Q08331 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Calb2Q08331 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Calb2Q08331 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Calb2Q08331 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Calb2Q08331 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Calb2Q08331 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Calb2Q08331 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Calb2Q08331 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Calb2Q08331 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Calb2Q08331 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Calb2Q08331 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calb2Q08331 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Calb2Q08331 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Calb2Q08331 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Calb2Q08331 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Calb2Q08331 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calb2Q08331 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calb2Q08331 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Calb2Q08331 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Calb2Q08331 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Calb2Q08331 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Calb2Q08331 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Calb2Q08331 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calb2Q08331 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Calb2Q08331 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Calb2Q08331 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Calb2Q08331 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Calb2Q08331 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Calb2Q08331 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calb2Q08331 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Calb2Q08331 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Calb2Q08331 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Calb2Q08331 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Calb2Q08331 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Calb2Q08331 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calb2Q08331 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calb2Q08331 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calb2Q08331 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calb2Q08331 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Calb2Q08331 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calb2Q08331 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calb2Q08331 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calb2Q08331 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Calb2Q08331 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Calb2Q08331 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Calb2Q08331 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Calb2Q08331 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Calb2Q08331 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Calb2Q08331 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Calb2Q08331 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Calb2Q08331 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Calb2Q08331 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Calb2Q08331 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Calb2Q08331 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Calb2Q08331 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Calb2Q08331 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Calb2Q08331 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Calb2Q08331 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Calb2Q08331 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Calb2Q08331 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Calb2Q08331 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Calb2Q08331 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Calb2Q08331 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Calb2Q08331 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Calb2Q08331 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Calb2Q08331 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Calb2Q08331 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Calb2Q08331 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Calb2Q08331 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calb2Q08331 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Calb2Q08331 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calb2Q08331 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Calb2Q08331 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calb2Q08331 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Calb2Q08331 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Calb2Q08331 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Calb2Q08331 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Calb2Q08331 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Calb2Q08331 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Calb2Q08331 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Calb2Q08331 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Calb2Q08331 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Calb2Q08331 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Calb2Q08331 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Calb2Q08331 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Calb2Q08331 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calb2Q08331 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Calb2Q08331 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Calb2Q08331 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Calb2Q08331 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Calb2Q08331 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Calb2Q08331 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Calb2Q08331 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Calb2Q08331 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Calb2Q08331 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Calb2Q08331 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calb2Q08331 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Calb2Q08331 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms