Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnn1Q08091 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnn1Q08091 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnn1Q08091 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnn1Q08091 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnn1Q08091 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnn1Q08091 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnn1Q08091 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnn1Q08091 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnn1Q08091 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnn1Q08091 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnn1Q08091 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnn1Q08091 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnn1Q08091 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnn1Q08091 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnn1Q08091 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnn1Q08091 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnn1Q08091 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnn1Q08091 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnn1Q08091 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnn1Q08091 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnn1Q08091 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cnn1Q08091 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnn1Q08091 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnn1Q08091 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnn1Q08091 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnn1Q08091 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnn1Q08091 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnn1Q08091 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnn1Q08091 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnn1Q08091 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnn1Q08091 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnn1Q08091 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnn1Q08091 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnn1Q08091 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cnn1Q08091 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cnn1Q08091 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cnn1Q08091 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnn1Q08091 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnn1Q08091 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cnn1Q08091 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnn1Q08091 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cnn1Q08091 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnn1Q08091 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cnn1Q08091 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cnn1Q08091 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cnn1Q08091 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cnn1Q08091 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cnn1Q08091 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnn1Q08091 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnn1Q08091 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnn1Q08091 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnn1Q08091 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnn1Q08091 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnn1Q08091 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnn1Q08091 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnn1Q08091 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnn1Q08091 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnn1Q08091 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnn1Q08091 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnn1Q08091 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnn1Q08091 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnn1Q08091 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cnn1Q08091 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnn1Q08091 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnn1Q08091 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cnn1Q08091 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cnn1Q08091 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Cnn1Q08091 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cnn1Q08091 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnn1Q08091 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cnn1Q08091 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cnn1Q08091 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnn1Q08091 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cnn1Q08091 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnn1Q08091 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cnn1Q08091 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cnn1Q08091 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cnn1Q08091 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnn1Q08091 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnn1Q08091 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnn1Q08091 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnn1Q08091 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnn1Q08091 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnn1Q08091 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnn1Q08091 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnn1Q08091 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnn1Q08091 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnn1Q08091 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnn1Q08091 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnn1Q08091 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnn1Q08091 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cnn1Q08091 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnn1Q08091 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnn1Q08091 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnn1Q08091 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnn1Q08091 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnn1Q08091 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cnn1Q08091 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cnn1Q08091 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms