Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdx4Q07424 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdx4Q07424 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdx4Q07424 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cdx4Q07424 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdx4Q07424 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdx4Q07424 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cdx4Q07424 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cdx4Q07424 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cdx4Q07424 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdx4Q07424 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cdx4Q07424 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cdx4Q07424 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cdx4Q07424 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cdx4Q07424 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cdx4Q07424 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cdx4Q07424 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cdx4Q07424 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cdx4Q07424 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdx4Q07424 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cdx4Q07424 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdx4Q07424 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cdx4Q07424 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdx4Q07424 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdx4Q07424 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cdx4Q07424 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cdx4Q07424 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cdx4Q07424 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cdx4Q07424 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cdx4Q07424 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdx4Q07424 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cdx4Q07424 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cdx4Q07424 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cdx4Q07424 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cdx4Q07424 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cdx4Q07424 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdx4Q07424 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdx4Q07424 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdx4Q07424 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdx4Q07424 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdx4Q07424 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdx4Q07424 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdx4Q07424 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdx4Q07424 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdx4Q07424 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cdx4Q07424 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cdx4Q07424 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdx4Q07424 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cdx4Q07424 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdx4Q07424 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cdx4Q07424 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cdx4Q07424 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cdx4Q07424 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cdx4Q07424 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdx4Q07424 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cdx4Q07424 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdx4Q07424 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdx4Q07424 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdx4Q07424 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdx4Q07424 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdx4Q07424 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdx4Q07424 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdx4Q07424 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdx4Q07424 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cdx4Q07424 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdx4Q07424 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdx4Q07424 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cdx4Q07424 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cdx4Q07424 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cdx4Q07424 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cdx4Q07424 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdx4Q07424 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdx4Q07424 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdx4Q07424 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdx4Q07424 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdx4Q07424 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdx4Q07424 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdx4Q07424 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdx4Q07424 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdx4Q07424 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdx4Q07424 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdx4Q07424 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdx4Q07424 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdx4Q07424 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdx4Q07424 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdx4Q07424 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdx4Q07424 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdx4Q07424 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cdx4Q07424 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cdx4Q07424 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cdx4Q07424 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdx4Q07424 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cdx4Q07424 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cdx4Q07424 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdx4Q07424 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cdx4Q07424 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cdx4Q07424 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdx4Q07424 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdx4Q07424 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cdx4Q07424 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms