Protein–RNA interactions for Protein: Q06806

Tie1, Tyrosine-protein kinase receptor Tie-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tie1Q06806 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Tie1Q06806 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Tie1Q06806 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Tie1Q06806 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Tie1Q06806 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Tie1Q06806 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Tie1Q06806 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Tie1Q06806 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Tie1Q06806 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Tie1Q06806 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,2■■□□□ 1,94
Tie1Q06806 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Tie1Q06806 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Tie1Q06806 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Tie1Q06806 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Tie1Q06806 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Tie1Q06806 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Tie1Q06806 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,1■■□□□ 1,93
Tie1Q06806 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Tie1Q06806 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Tie1Q06806 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Tie1Q06806 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Tie1Q06806 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Tie1Q06806 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Tie1Q06806 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Tie1Q06806 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Tie1Q06806 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Tie1Q06806 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Tie1Q06806 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,87■■□□□ 1,89
Tie1Q06806 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Tie1Q06806 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Tie1Q06806 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Tie1Q06806 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Tie1Q06806 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Tie1Q06806 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26,83■■□□□ 1,89
Tie1Q06806 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
Tie1Q06806 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Tie1Q06806 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Tie1Q06806 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Tie1Q06806 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Tie1Q06806 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Tie1Q06806 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Tie1Q06806 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Tie1Q06806 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26,7■■□□□ 1,86
Tie1Q06806 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Tie1Q06806 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Tie1Q06806 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Tie1Q06806 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Tie1Q06806 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Tie1Q06806 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Tie1Q06806 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,6■■□□□ 1,85
Tie1Q06806 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Tie1Q06806 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Tie1Q06806 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Tie1Q06806 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Tie1Q06806 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Tie1Q06806 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Tie1Q06806 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26,5■■□□□ 1,83
Tie1Q06806 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Tie1Q06806 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Tie1Q06806 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Tie1Q06806 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Tie1Q06806 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Tie1Q06806 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Tie1Q06806 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
Tie1Q06806 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Tie1Q06806 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Tie1Q06806 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Tie1Q06806 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
Tie1Q06806 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Tie1Q06806 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Tie1Q06806 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Tie1Q06806 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,25■■□□□ 1,79
Tie1Q06806 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Tie1Q06806 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Tie1Q06806 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Tie1Q06806 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Tie1Q06806 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Tie1Q06806 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26,18■■□□□ 1,78
Tie1Q06806 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Tie1Q06806 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Tie1Q06806 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
Tie1Q06806 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Tie1Q06806 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Tie1Q06806 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26,13■■□□□ 1,77
Tie1Q06806 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Tie1Q06806 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Tie1Q06806 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Tie1Q06806 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Tie1Q06806 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Tie1Q06806 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Tie1Q06806 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Tie1Q06806 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Tie1Q06806 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Tie1Q06806 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Tie1Q06806 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Tie1Q06806 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Tie1Q06806 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Tie1Q06806 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Tie1Q06806 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Tie1Q06806 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,99■■□□□ 1,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,4 ms