Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cab39Q06138 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cab39Q06138 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cab39Q06138 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cab39Q06138 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cab39Q06138 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cab39Q06138 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cab39Q06138 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cab39Q06138 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cab39Q06138 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cab39Q06138 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cab39Q06138 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cab39Q06138 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cab39Q06138 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cab39Q06138 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cab39Q06138 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cab39Q06138 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cab39Q06138 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cab39Q06138 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cab39Q06138 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cab39Q06138 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cab39Q06138 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cab39Q06138 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cab39Q06138 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cab39Q06138 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cab39Q06138 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cab39Q06138 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cab39Q06138 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cab39Q06138 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cab39Q06138 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cab39Q06138 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cab39Q06138 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cab39Q06138 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cab39Q06138 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cab39Q06138 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cab39Q06138 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cab39Q06138 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cab39Q06138 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cab39Q06138 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cab39Q06138 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cab39Q06138 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cab39Q06138 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cab39Q06138 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cab39Q06138 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cab39Q06138 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Cab39Q06138 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cab39Q06138 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cab39Q06138 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cab39Q06138 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cab39Q06138 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cab39Q06138 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cab39Q06138 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cab39Q06138 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cab39Q06138 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cab39Q06138 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cab39Q06138 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cab39Q06138 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cab39Q06138 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cab39Q06138 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cab39Q06138 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cab39Q06138 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cab39Q06138 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cab39Q06138 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cab39Q06138 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cab39Q06138 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cab39Q06138 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cab39Q06138 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cab39Q06138 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cab39Q06138 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cab39Q06138 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cab39Q06138 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cab39Q06138 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cab39Q06138 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cab39Q06138 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cab39Q06138 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cab39Q06138 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cab39Q06138 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cab39Q06138 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cab39Q06138 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cab39Q06138 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cab39Q06138 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cab39Q06138 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cab39Q06138 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cab39Q06138 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cab39Q06138 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cab39Q06138 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cab39Q06138 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cab39Q06138 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cab39Q06138 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cab39Q06138 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cab39Q06138 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cab39Q06138 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cab39Q06138 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cab39Q06138 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cab39Q06138 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cab39Q06138 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cab39Q06138 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cab39Q06138 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cab39Q06138 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cab39Q06138 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms