Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apoc2Q05020 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apoc2Q05020 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apoc2Q05020 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apoc2Q05020 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apoc2Q05020 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Apoc2Q05020 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apoc2Q05020 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apoc2Q05020 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apoc2Q05020 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apoc2Q05020 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apoc2Q05020 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apoc2Q05020 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apoc2Q05020 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apoc2Q05020 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apoc2Q05020 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apoc2Q05020 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apoc2Q05020 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apoc2Q05020 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apoc2Q05020 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Apoc2Q05020 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apoc2Q05020 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apoc2Q05020 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apoc2Q05020 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Apoc2Q05020 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apoc2Q05020 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apoc2Q05020 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apoc2Q05020 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Apoc2Q05020 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Apoc2Q05020 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apoc2Q05020 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Apoc2Q05020 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Apoc2Q05020 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Apoc2Q05020 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Apoc2Q05020 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Apoc2Q05020 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apoc2Q05020 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apoc2Q05020 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Apoc2Q05020 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Apoc2Q05020 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Apoc2Q05020 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apoc2Q05020 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Apoc2Q05020 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apoc2Q05020 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apoc2Q05020 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Apoc2Q05020 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apoc2Q05020 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Apoc2Q05020 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apoc2Q05020 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Apoc2Q05020 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Apoc2Q05020 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Apoc2Q05020 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Apoc2Q05020 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Apoc2Q05020 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Apoc2Q05020 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Apoc2Q05020 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Apoc2Q05020 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apoc2Q05020 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Apoc2Q05020 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Apoc2Q05020 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apoc2Q05020 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Apoc2Q05020 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Apoc2Q05020 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Apoc2Q05020 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apoc2Q05020 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Apoc2Q05020 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Apoc2Q05020 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apoc2Q05020 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Apoc2Q05020 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Apoc2Q05020 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Apoc2Q05020 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Apoc2Q05020 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Apoc2Q05020 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Apoc2Q05020 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Apoc2Q05020 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Apoc2Q05020 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoc2Q05020 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Apoc2Q05020 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Apoc2Q05020 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apoc2Q05020 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Apoc2Q05020 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Apoc2Q05020 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apoc2Q05020 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apoc2Q05020 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Apoc2Q05020 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Apoc2Q05020 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apoc2Q05020 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Apoc2Q05020 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apoc2Q05020 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Apoc2Q05020 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apoc2Q05020 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apoc2Q05020 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Apoc2Q05020 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apoc2Q05020 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apoc2Q05020 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Apoc2Q05020 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Apoc2Q05020 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apoc2Q05020 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apoc2Q05020 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apoc2Q05020 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms