Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Apoc2Q05020 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Apoc2Q05020 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Apoc2Q05020 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,26■■□□□ 1,47
Apoc2Q05020 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24,22■■□□□ 1,47
Apoc2Q05020 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Apoc2Q05020 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,17■■□□□ 1,46
Apoc2Q05020 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Apoc2Q05020 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,16■■□□□ 1,46
Apoc2Q05020 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,15■■□□□ 1,46
Apoc2Q05020 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Apoc2Q05020 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Apoc2Q05020 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Apoc2Q05020 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Apoc2Q05020 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Apoc2Q05020 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Apoc2Q05020 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Apoc2Q05020 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Apoc2Q05020 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Apoc2Q05020 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,98■■□□□ 1,43
Apoc2Q05020 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Apoc2Q05020 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Apoc2Q05020 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,96■■□□□ 1,43
Apoc2Q05020 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,95■■□□□ 1,42
Apoc2Q05020 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Apoc2Q05020 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Apoc2Q05020 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Apoc2Q05020 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,86■■□□□ 1,41
Apoc2Q05020 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
Apoc2Q05020 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Apoc2Q05020 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Apoc2Q05020 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Apoc2Q05020 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Apoc2Q05020 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Apoc2Q05020 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Apoc2Q05020 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Apoc2Q05020 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Apoc2Q05020 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Apoc2Q05020 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23,68■■□□□ 1,38
Apoc2Q05020 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Apoc2Q05020 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23,65■■□□□ 1,38
Apoc2Q05020 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Apoc2Q05020 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Apoc2Q05020 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Apoc2Q05020 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Apoc2Q05020 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Apoc2Q05020 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Apoc2Q05020 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Apoc2Q05020 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,62■■□□□ 1,37
Apoc2Q05020 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Apoc2Q05020 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,61■■□□□ 1,37
Apoc2Q05020 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
Apoc2Q05020 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Apoc2Q05020 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Apoc2Q05020 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,37
Apoc2Q05020 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Apoc2Q05020 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Apoc2Q05020 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Apoc2Q05020 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Apoc2Q05020 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Apoc2Q05020 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Apoc2Q05020 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Apoc2Q05020 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Apoc2Q05020 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Apoc2Q05020 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Apoc2Q05020 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Apoc2Q05020 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Apoc2Q05020 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Apoc2Q05020 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,38■■□□□ 1,33
Apoc2Q05020 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Apoc2Q05020 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Apoc2Q05020 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Apoc2Q05020 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Apoc2Q05020 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23,33■■□□□ 1,33
Apoc2Q05020 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Apoc2Q05020 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Apoc2Q05020 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Apoc2Q05020 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Apoc2Q05020 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Apoc2Q05020 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Apoc2Q05020 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Apoc2Q05020 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Apoc2Q05020 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Apoc2Q05020 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Apoc2Q05020 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Apoc2Q05020 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Apoc2Q05020 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Apoc2Q05020 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Apoc2Q05020 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Apoc2Q05020 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Apoc2Q05020 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Apoc2Q05020 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23,21■■□□□ 1,31
Apoc2Q05020 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Apoc2Q05020 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Apoc2Q05020 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23,17■■□□□ 1,3
Apoc2Q05020 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23,16■■□□□ 1,3
Apoc2Q05020 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Apoc2Q05020 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Apoc2Q05020 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Apoc2Q05020 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms