Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Kcnd1Q03719 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kcnd1Q03719 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Kcnd1Q03719 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Kcnd1Q03719 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kcnd1Q03719 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Kcnd1Q03719 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kcnd1Q03719 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kcnd1Q03719 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Kcnd1Q03719 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kcnd1Q03719 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kcnd1Q03719 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kcnd1Q03719 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kcnd1Q03719 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kcnd1Q03719 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kcnd1Q03719 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kcnd1Q03719 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kcnd1Q03719 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Kcnd1Q03719 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kcnd1Q03719 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kcnd1Q03719 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Kcnd1Q03719 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kcnd1Q03719 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Kcnd1Q03719 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kcnd1Q03719 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kcnd1Q03719 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kcnd1Q03719 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kcnd1Q03719 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kcnd1Q03719 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kcnd1Q03719 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kcnd1Q03719 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kcnd1Q03719 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kcnd1Q03719 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Kcnd1Q03719 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Kcnd1Q03719 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kcnd1Q03719 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Kcnd1Q03719 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kcnd1Q03719 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kcnd1Q03719 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kcnd1Q03719 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kcnd1Q03719 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kcnd1Q03719 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kcnd1Q03719 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kcnd1Q03719 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Kcnd1Q03719 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Kcnd1Q03719 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kcnd1Q03719 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kcnd1Q03719 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kcnd1Q03719 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Kcnd1Q03719 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kcnd1Q03719 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kcnd1Q03719 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kcnd1Q03719 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Kcnd1Q03719 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kcnd1Q03719 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Kcnd1Q03719 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Kcnd1Q03719 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Kcnd1Q03719 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Kcnd1Q03719 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Kcnd1Q03719 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Kcnd1Q03719 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kcnd1Q03719 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Kcnd1Q03719 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Kcnd1Q03719 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Kcnd1Q03719 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Kcnd1Q03719 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Kcnd1Q03719 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Kcnd1Q03719 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kcnd1Q03719 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Kcnd1Q03719 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kcnd1Q03719 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Kcnd1Q03719 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kcnd1Q03719 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kcnd1Q03719 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Kcnd1Q03719 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Kcnd1Q03719 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Kcnd1Q03719 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Kcnd1Q03719 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Kcnd1Q03719 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Kcnd1Q03719 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Kcnd1Q03719 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Kcnd1Q03719 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kcnd1Q03719 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Kcnd1Q03719 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Kcnd1Q03719 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Kcnd1Q03719 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kcnd1Q03719 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Kcnd1Q03719 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Kcnd1Q03719 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Kcnd1Q03719 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kcnd1Q03719 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Kcnd1Q03719 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Kcnd1Q03719 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kcnd1Q03719 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Kcnd1Q03719 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kcnd1Q03719 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Kcnd1Q03719 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kcnd1Q03719 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Kcnd1Q03719 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Kcnd1Q03719 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms