Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Scg2Q03517 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32,44■■■□□ 2,78
Scg2Q03517 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,44■■■□□ 2,78
Scg2Q03517 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,43■■■□□ 2,78
Scg2Q03517 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32,39■■■□□ 2,78
Scg2Q03517 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32,39■■■□□ 2,78
Scg2Q03517 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32,36■■■□□ 2,77
Scg2Q03517 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,34■■■□□ 2,77
Scg2Q03517 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
Scg2Q03517 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,32■■■□□ 2,76
Scg2Q03517 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,24■■■□□ 2,75
Scg2Q03517 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32,24■■■□□ 2,75
Scg2Q03517 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Scg2Q03517 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,17■■■□□ 2,74
Scg2Q03517 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,16■■■□□ 2,74
Scg2Q03517 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32,15■■■□□ 2,74
Scg2Q03517 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Scg2Q03517 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Scg2Q03517 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Scg2Q03517 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
Scg2Q03517 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Scg2Q03517 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32,02■■■□□ 2,72
Scg2Q03517 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,01■■■□□ 2,71
Scg2Q03517 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Scg2Q03517 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31,92■■■□□ 2,7
Scg2Q03517 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,91■■■□□ 2,7
Scg2Q03517 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,9■■■□□ 2,7
Scg2Q03517 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,87■■■□□ 2,69
Scg2Q03517 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31,87■■■□□ 2,69
Scg2Q03517 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,86■■■□□ 2,69
Scg2Q03517 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31,85■■■□□ 2,69
Scg2Q03517 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Scg2Q03517 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Scg2Q03517 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Scg2Q03517 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,82■■■□□ 2,68
Scg2Q03517 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,81■■■□□ 2,68
Scg2Q03517 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Scg2Q03517 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Scg2Q03517 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31,7■■■□□ 2,67
Scg2Q03517 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,7■■■□□ 2,67
Scg2Q03517 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Scg2Q03517 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,66■■■□□ 2,66
Scg2Q03517 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31,64■■■□□ 2,66
Scg2Q03517 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31,63■■■□□ 2,65
Scg2Q03517 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31,61■■■□□ 2,65
Scg2Q03517 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,6■■■□□ 2,65
Scg2Q03517 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31,54■■■□□ 2,64
Scg2Q03517 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,51■■■□□ 2,63
Scg2Q03517 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31,5■■■□□ 2,63
Scg2Q03517 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31,49■■■□□ 2,63
Scg2Q03517 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,49■■■□□ 2,63
Scg2Q03517 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Scg2Q03517 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31,4■■■□□ 2,62
Scg2Q03517 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Scg2Q03517 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Scg2Q03517 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Scg2Q03517 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,61
Scg2Q03517 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31,3■■■□□ 2,6
Scg2Q03517 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Scg2Q03517 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Scg2Q03517 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31,25■■■□□ 2,59
Scg2Q03517 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,24■■■□□ 2,59
Scg2Q03517 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Scg2Q03517 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Scg2Q03517 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31,23■■■□□ 2,59
Scg2Q03517 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Scg2Q03517 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Scg2Q03517 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Scg2Q03517 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Scg2Q03517 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,1■■■□□ 2,57
Scg2Q03517 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,09■■■□□ 2,57
Scg2Q03517 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Scg2Q03517 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Scg2Q03517 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Scg2Q03517 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Scg2Q03517 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31,02■■■□□ 2,56
Scg2Q03517 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,02■■■□□ 2,56
Scg2Q03517 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,99■■■□□ 2,55
Scg2Q03517 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Scg2Q03517 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Scg2Q03517 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Scg2Q03517 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Scg2Q03517 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,95■■■□□ 2,55
Scg2Q03517 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Scg2Q03517 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Scg2Q03517 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Scg2Q03517 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Scg2Q03517 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Scg2Q03517 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Scg2Q03517 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Scg2Q03517 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Scg2Q03517 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30,79■■■□□ 2,52
Scg2Q03517 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Scg2Q03517 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,73■■■□□ 2,51
Scg2Q03517 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,71■■■□□ 2,51
Scg2Q03517 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,7■■■□□ 2,51
Scg2Q03517 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,51
Scg2Q03517 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Scg2Q03517 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Scg2Q03517 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,4 ms