Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gjb5Q02739 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gjb5Q02739 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gjb5Q02739 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gjb5Q02739 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gjb5Q02739 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gjb5Q02739 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gjb5Q02739 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gjb5Q02739 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gjb5Q02739 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gjb5Q02739 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gjb5Q02739 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gjb5Q02739 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Gjb5Q02739 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gjb5Q02739 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gjb5Q02739 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gjb5Q02739 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gjb5Q02739 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gjb5Q02739 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gjb5Q02739 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gjb5Q02739 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gjb5Q02739 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gjb5Q02739 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gjb5Q02739 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gjb5Q02739 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gjb5Q02739 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gjb5Q02739 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Gjb5Q02739 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gjb5Q02739 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gjb5Q02739 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gjb5Q02739 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gjb5Q02739 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gjb5Q02739 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gjb5Q02739 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gjb5Q02739 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gjb5Q02739 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gjb5Q02739 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gjb5Q02739 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gjb5Q02739 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gjb5Q02739 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gjb5Q02739 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Gjb5Q02739 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Gjb5Q02739 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gjb5Q02739 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gjb5Q02739 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gjb5Q02739 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gjb5Q02739 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjb5Q02739 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gjb5Q02739 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gjb5Q02739 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gjb5Q02739 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gjb5Q02739 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gjb5Q02739 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gjb5Q02739 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gjb5Q02739 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gjb5Q02739 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gjb5Q02739 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Gjb5Q02739 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gjb5Q02739 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gjb5Q02739 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gjb5Q02739 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gjb5Q02739 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gjb5Q02739 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gjb5Q02739 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gjb5Q02739 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gjb5Q02739 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gjb5Q02739 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gjb5Q02739 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gjb5Q02739 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gjb5Q02739 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gjb5Q02739 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gjb5Q02739 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gjb5Q02739 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gjb5Q02739 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gjb5Q02739 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gjb5Q02739 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gjb5Q02739 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Gjb5Q02739 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gjb5Q02739 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gjb5Q02739 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gjb5Q02739 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gjb5Q02739 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gjb5Q02739 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gjb5Q02739 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gjb5Q02739 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gjb5Q02739 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gjb5Q02739 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gjb5Q02739 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gjb5Q02739 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gjb5Q02739 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gjb5Q02739 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gjb5Q02739 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gjb5Q02739 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gjb5Q02739 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gjb5Q02739 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb5Q02739 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb5Q02739 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gjb5Q02739 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gjb5Q02739 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gjb5Q02739 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms