Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cacna1cQ01815 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cacna1cQ01815 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cacna1cQ01815 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cacna1cQ01815 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna1cQ01815 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cacna1cQ01815 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cacna1cQ01815 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cacna1cQ01815 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cacna1cQ01815 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cacna1cQ01815 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cacna1cQ01815 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna1cQ01815 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna1cQ01815 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cacna1cQ01815 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1cQ01815 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cacna1cQ01815 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cacna1cQ01815 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1cQ01815 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cacna1cQ01815 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cacna1cQ01815 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1cQ01815 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1cQ01815 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cacna1cQ01815 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cacna1cQ01815 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cacna1cQ01815 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cacna1cQ01815 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cacna1cQ01815 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cacna1cQ01815 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cacna1cQ01815 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna1cQ01815 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cacna1cQ01815 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cacna1cQ01815 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cacna1cQ01815 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cacna1cQ01815 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cacna1cQ01815 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cacna1cQ01815 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cacna1cQ01815 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1cQ01815 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1cQ01815 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1cQ01815 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cacna1cQ01815 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cacna1cQ01815 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cacna1cQ01815 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cacna1cQ01815 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cacna1cQ01815 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1cQ01815 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cacna1cQ01815 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1cQ01815 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cacna1cQ01815 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cacna1cQ01815 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cacna1cQ01815 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1cQ01815 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1cQ01815 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cacna1cQ01815 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1cQ01815 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cacna1cQ01815 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cacna1cQ01815 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cacna1cQ01815 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cacna1cQ01815 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cacna1cQ01815 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacna1cQ01815 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cacna1cQ01815 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cacna1cQ01815 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1cQ01815 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cacna1cQ01815 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cacna1cQ01815 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1cQ01815 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cacna1cQ01815 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacna1cQ01815 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cacna1cQ01815 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna1cQ01815 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cacna1cQ01815 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cacna1cQ01815 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cacna1cQ01815 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cacna1cQ01815 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1cQ01815 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Cacna1cQ01815 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacna1cQ01815 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacna1cQ01815 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1cQ01815 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1cQ01815 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1cQ01815 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1cQ01815 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1cQ01815 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1cQ01815 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cacna1cQ01815 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cacna1cQ01815 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cacna1cQ01815 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cacna1cQ01815 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna1cQ01815 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna1cQ01815 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cacna1cQ01815 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cacna1cQ01815 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cacna1cQ01815 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cacna1cQ01815 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1cQ01815 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1cQ01815 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cacna1cQ01815 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cacna1cQ01815 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms