Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smn1P97801 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smn1P97801 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smn1P97801 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smn1P97801 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smn1P97801 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smn1P97801 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smn1P97801 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smn1P97801 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smn1P97801 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smn1P97801 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smn1P97801 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smn1P97801 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smn1P97801 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smn1P97801 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smn1P97801 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smn1P97801 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smn1P97801 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smn1P97801 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smn1P97801 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smn1P97801 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smn1P97801 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smn1P97801 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smn1P97801 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smn1P97801 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smn1P97801 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smn1P97801 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smn1P97801 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Smn1P97801 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smn1P97801 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smn1P97801 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smn1P97801 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smn1P97801 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smn1P97801 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smn1P97801 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smn1P97801 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smn1P97801 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Smn1P97801 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smn1P97801 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smn1P97801 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smn1P97801 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smn1P97801 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smn1P97801 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smn1P97801 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smn1P97801 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smn1P97801 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smn1P97801 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smn1P97801 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smn1P97801 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smn1P97801 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smn1P97801 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smn1P97801 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smn1P97801 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smn1P97801 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smn1P97801 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smn1P97801 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smn1P97801 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smn1P97801 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smn1P97801 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smn1P97801 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smn1P97801 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smn1P97801 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smn1P97801 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smn1P97801 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smn1P97801 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smn1P97801 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smn1P97801 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smn1P97801 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smn1P97801 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smn1P97801 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smn1P97801 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smn1P97801 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smn1P97801 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smn1P97801 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smn1P97801 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smn1P97801 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smn1P97801 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smn1P97801 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smn1P97801 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Smn1P97801 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smn1P97801 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smn1P97801 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smn1P97801 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smn1P97801 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smn1P97801 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smn1P97801 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smn1P97801 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smn1P97801 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smn1P97801 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smn1P97801 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smn1P97801 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smn1P97801 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Smn1P97801 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smn1P97801 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smn1P97801 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Smn1P97801 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smn1P97801 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smn1P97801 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smn1P97801 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smn1P97801 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms