Protein–RNA interactions for Protein: P97479

Myo7a, Unconventional myosin-VIIa, mousemouse

Predictions only

Length 2,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo7aP97479 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Myo7aP97479 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Myo7aP97479 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Myo7aP97479 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Myo7aP97479 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Myo7aP97479 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Myo7aP97479 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Myo7aP97479 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Myo7aP97479 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Myo7aP97479 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Myo7aP97479 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Myo7aP97479 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Myo7aP97479 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Myo7aP97479 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Myo7aP97479 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Myo7aP97479 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Myo7aP97479 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Myo7aP97479 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Myo7aP97479 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Myo7aP97479 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Myo7aP97479 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Myo7aP97479 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Myo7aP97479 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Myo7aP97479 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Myo7aP97479 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Myo7aP97479 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Myo7aP97479 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Myo7aP97479 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Myo7aP97479 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Myo7aP97479 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Myo7aP97479 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Myo7aP97479 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myo7aP97479 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Myo7aP97479 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Myo7aP97479 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Myo7aP97479 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Myo7aP97479 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Myo7aP97479 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Myo7aP97479 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo7aP97479 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Myo7aP97479 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Myo7aP97479 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Myo7aP97479 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Myo7aP97479 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Myo7aP97479 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Myo7aP97479 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Myo7aP97479 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myo7aP97479 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Myo7aP97479 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Myo7aP97479 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myo7aP97479 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Myo7aP97479 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Myo7aP97479 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Myo7aP97479 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myo7aP97479 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Myo7aP97479 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Myo7aP97479 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Myo7aP97479 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Myo7aP97479 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Myo7aP97479 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Myo7aP97479 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Myo7aP97479 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Myo7aP97479 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Myo7aP97479 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Myo7aP97479 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Myo7aP97479 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Myo7aP97479 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Myo7aP97479 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Myo7aP97479 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Myo7aP97479 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Myo7aP97479 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Myo7aP97479 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Myo7aP97479 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Myo7aP97479 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myo7aP97479 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Myo7aP97479 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Myo7aP97479 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Myo7aP97479 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Myo7aP97479 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Myo7aP97479 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo7aP97479 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Myo7aP97479 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Myo7aP97479 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Myo7aP97479 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Myo7aP97479 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Myo7aP97479 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Myo7aP97479 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myo7aP97479 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Myo7aP97479 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Myo7aP97479 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Myo7aP97479 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Myo7aP97479 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Myo7aP97479 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Myo7aP97479 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Myo7aP97479 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Myo7aP97479 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Myo7aP97479 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Myo7aP97479 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Myo7aP97479 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Myo7aP97479 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms