Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Prop1P97458 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Prop1P97458 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Prop1P97458 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,78■■□□□ 1,4
Prop1P97458 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Prop1P97458 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Prop1P97458 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23,76■■□□□ 1,39
Prop1P97458 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23,76■■□□□ 1,39
Prop1P97458 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Prop1P97458 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Prop1P97458 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Prop1P97458 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,7■■□□□ 1,39
Prop1P97458 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Prop1P97458 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23,67■■□□□ 1,38
Prop1P97458 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23,67■■□□□ 1,38
Prop1P97458 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Prop1P97458 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Prop1P97458 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Prop1P97458 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,58■■□□□ 1,36
Prop1P97458 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
Prop1P97458 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23,52■■□□□ 1,36
Prop1P97458 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,5■■□□□ 1,35
Prop1P97458 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Prop1P97458 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Prop1P97458 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Prop1P97458 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Prop1P97458 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Prop1P97458 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,38■■□□□ 1,33
Prop1P97458 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Prop1P97458 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Prop1P97458 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Prop1P97458 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23,35■■□□□ 1,33
Prop1P97458 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Prop1P97458 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Prop1P97458 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Prop1P97458 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23,28■■□□□ 1,32
Prop1P97458 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Prop1P97458 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Prop1P97458 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Prop1P97458 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Prop1P97458 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,19■■□□□ 1,3
Prop1P97458 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Prop1P97458 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Prop1P97458 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Prop1P97458 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Prop1P97458 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23,14■■□□□ 1,29
Prop1P97458 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Prop1P97458 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Prop1P97458 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,12■■□□□ 1,29
Prop1P97458 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Prop1P97458 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,09■■□□□ 1,29
Prop1P97458 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Prop1P97458 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Prop1P97458 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Prop1P97458 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Prop1P97458 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Prop1P97458 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Prop1P97458 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Prop1P97458 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Prop1P97458 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22,98■■□□□ 1,27
Prop1P97458 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22,96■■□□□ 1,27
Prop1P97458 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22,96■■□□□ 1,27
Prop1P97458 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22,9■■□□□ 1,26
Prop1P97458 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Prop1P97458 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Prop1P97458 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Prop1P97458 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Prop1P97458 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,79■■□□□ 1,24
Prop1P97458 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Prop1P97458 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Prop1P97458 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Prop1P97458 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Prop1P97458 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Prop1P97458 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Prop1P97458 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Prop1P97458 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Prop1P97458 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Prop1P97458 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22,72■■□□□ 1,23
Prop1P97458 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Prop1P97458 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,23
Prop1P97458 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Prop1P97458 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Prop1P97458 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Prop1P97458 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,64■■□□□ 1,21
Prop1P97458 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Prop1P97458 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Prop1P97458 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22,61■■□□□ 1,21
Prop1P97458 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Prop1P97458 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Prop1P97458 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Prop1P97458 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Prop1P97458 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Prop1P97458 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Prop1P97458 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Prop1P97458 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Prop1P97458 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Prop1P97458 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Prop1P97458 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Prop1P97458 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,51■■□□□ 1,19
Prop1P97458 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22,49■■□□□ 1,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,3 ms