Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35,63■■■■□ 3,29
Atp1b3P97370 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Atp1b3P97370 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,52■■■■□ 3,28
Atp1b3P97370 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Atp1b3P97370 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Atp1b3P97370 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Atp1b3P97370 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Atp1b3P97370 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Atp1b3P97370 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Atp1b3P97370 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,25
Atp1b3P97370 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Atp1b3P97370 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Atp1b3P97370 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Atp1b3P97370 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35,26■■■■□ 3,23
Atp1b3P97370 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35,24■■■■□ 3,23
Atp1b3P97370 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Atp1b3P97370 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35,2■■■■□ 3,22
Atp1b3P97370 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Atp1b3P97370 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35,07■■■■□ 3,2
Atp1b3P97370 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Atp1b3P97370 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Atp1b3P97370 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,01■■■■□ 3,2
Atp1b3P97370 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Atp1b3P97370 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Atp1b3P97370 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Atp1b3P97370 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,9■■■■□ 3,18
Atp1b3P97370 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,87■■■■□ 3,17
Atp1b3P97370 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,87■■■■□ 3,17
Atp1b3P97370 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34,86■■■■□ 3,17
Atp1b3P97370 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Atp1b3P97370 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Atp1b3P97370 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Atp1b3P97370 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,81■■■■□ 3,16
Atp1b3P97370 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Atp1b3P97370 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Atp1b3P97370 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Atp1b3P97370 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,15
Atp1b3P97370 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
Atp1b3P97370 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,73■■■■□ 3,15
Atp1b3P97370 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Atp1b3P97370 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,69■■■■□ 3,14
Atp1b3P97370 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Atp1b3P97370 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Atp1b3P97370 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Atp1b3P97370 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,61■■■■□ 3,13
Atp1b3P97370 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Atp1b3P97370 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,59■■■■□ 3,13
Atp1b3P97370 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Atp1b3P97370 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,51■■■■□ 3,12
Atp1b3P97370 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34,5■■■■□ 3,11
Atp1b3P97370 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,43■■■■□ 3,1
Atp1b3P97370 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,41■■■■□ 3,1
Atp1b3P97370 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Atp1b3P97370 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34,35■■■■□ 3,09
Atp1b3P97370 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Atp1b3P97370 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Atp1b3P97370 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,32■■■■□ 3,08
Atp1b3P97370 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Atp1b3P97370 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Atp1b3P97370 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,26■■■■□ 3,07
Atp1b3P97370 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Atp1b3P97370 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,25■■■■□ 3,07
Atp1b3P97370 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,23■■■■□ 3,07
Atp1b3P97370 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Atp1b3P97370 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Atp1b3P97370 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Atp1b3P97370 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Atp1b3P97370 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
Atp1b3P97370 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34,13■■■■□ 3,05
Atp1b3P97370 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34,12■■■■□ 3,05
Atp1b3P97370 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Atp1b3P97370 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,09■■■■□ 3,05
Atp1b3P97370 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Atp1b3P97370 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Atp1b3P97370 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,96■■■■□ 3,03
Atp1b3P97370 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Atp1b3P97370 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,92■■■■□ 3,02
Atp1b3P97370 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33,9■■■■□ 3,02
Atp1b3P97370 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Atp1b3P97370 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Atp1b3P97370 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33,86■■■■□ 3,01
Atp1b3P97370 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33,86■■■■□ 3,01
Atp1b3P97370 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33,86■■■■□ 3,01
Atp1b3P97370 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Atp1b3P97370 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Atp1b3P97370 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33,83■■■■□ 3,01
Atp1b3P97370 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Atp1b3P97370 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Atp1b3P97370 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33,81■■■■□ 3
Atp1b3P97370 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Atp1b3P97370 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33,79■■■■□ 3
Atp1b3P97370 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33,79■■■■□ 3
Atp1b3P97370 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Atp1b3P97370 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Atp1b3P97370 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,73■■■□□ 2,99
Atp1b3P97370 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Atp1b3P97370 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33,7■■■□□ 2,99
Atp1b3P97370 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33,7■■■□□ 2,99
Atp1b3P97370 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
Atp1b3P97370 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41,6 ms