Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Irx1P81068 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Irx1P81068 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Irx1P81068 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Irx1P81068 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Irx1P81068 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Irx1P81068 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Irx1P81068 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Irx1P81068 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Irx1P81068 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Irx1P81068 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Irx1P81068 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Irx1P81068 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Irx1P81068 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Irx1P81068 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Irx1P81068 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Irx1P81068 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Irx1P81068 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Irx1P81068 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Irx1P81068 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Irx1P81068 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Irx1P81068 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Irx1P81068 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Irx1P81068 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Irx1P81068 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Irx1P81068 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
Irx1P81068 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Irx1P81068 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Irx1P81068 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Irx1P81068 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Irx1P81068 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Irx1P81068 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,82■■■□□ 2,04
Irx1P81068 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Irx1P81068 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Irx1P81068 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Irx1P81068 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Irx1P81068 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Irx1P81068 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,74■■■□□ 2,03
Irx1P81068 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Irx1P81068 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Irx1P81068 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Irx1P81068 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Irx1P81068 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Irx1P81068 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Irx1P81068 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Irx1P81068 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Irx1P81068 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Irx1P81068 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Irx1P81068 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,53■■■□□ 2
Irx1P81068 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Irx1P81068 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Irx1P81068 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Irx1P81068 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Irx1P81068 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Irx1P81068 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Irx1P81068 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Irx1P81068 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Irx1P81068 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,39■■□□□ 1,97
Irx1P81068 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Irx1P81068 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Irx1P81068 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Irx1P81068 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Irx1P81068 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Irx1P81068 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,33■■□□□ 1,96
Irx1P81068 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Irx1P81068 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Irx1P81068 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Irx1P81068 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Irx1P81068 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Irx1P81068 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Irx1P81068 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Irx1P81068 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Irx1P81068 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
Irx1P81068 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Irx1P81068 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Irx1P81068 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Irx1P81068 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Irx1P81068 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,95
Irx1P81068 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Irx1P81068 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Irx1P81068 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
Irx1P81068 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Irx1P81068 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
Irx1P81068 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Irx1P81068 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Irx1P81068 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Irx1P81068 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Irx1P81068 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Irx1P81068 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Irx1P81068 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Irx1P81068 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Irx1P81068 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Irx1P81068 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Irx1P81068 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Irx1P81068 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Irx1P81068 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Irx1P81068 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Irx1P81068 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Irx1P81068 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Irx1P81068 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39,2 ms