Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ptprn2P80560 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ptprn2P80560 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ptprn2P80560 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ptprn2P80560 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ptprn2P80560 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ptprn2P80560 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ptprn2P80560 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ptprn2P80560 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ptprn2P80560 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ptprn2P80560 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ptprn2P80560 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ptprn2P80560 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ptprn2P80560 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ptprn2P80560 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ptprn2P80560 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ptprn2P80560 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ptprn2P80560 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ptprn2P80560 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ptprn2P80560 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ptprn2P80560 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ptprn2P80560 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ptprn2P80560 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ptprn2P80560 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ptprn2P80560 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ptprn2P80560 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ptprn2P80560 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ptprn2P80560 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ptprn2P80560 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ptprn2P80560 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ptprn2P80560 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ptprn2P80560 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ptprn2P80560 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ptprn2P80560 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ptprn2P80560 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ptprn2P80560 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ptprn2P80560 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ptprn2P80560 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ptprn2P80560 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ptprn2P80560 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ptprn2P80560 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptprn2P80560 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ptprn2P80560 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ptprn2P80560 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ptprn2P80560 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ptprn2P80560 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ptprn2P80560 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Ptprn2P80560 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ptprn2P80560 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ptprn2P80560 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ptprn2P80560 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ptprn2P80560 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ptprn2P80560 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ptprn2P80560 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ptprn2P80560 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ptprn2P80560 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ptprn2P80560 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ptprn2P80560 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ptprn2P80560 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ptprn2P80560 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ptprn2P80560 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ptprn2P80560 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ptprn2P80560 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ptprn2P80560 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ptprn2P80560 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ptprn2P80560 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ptprn2P80560 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ptprn2P80560 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ptprn2P80560 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ptprn2P80560 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ptprn2P80560 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ptprn2P80560 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ptprn2P80560 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ptprn2P80560 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ptprn2P80560 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ptprn2P80560 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ptprn2P80560 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ptprn2P80560 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ptprn2P80560 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ptprn2P80560 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ptprn2P80560 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ptprn2P80560 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ptprn2P80560 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ptprn2P80560 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ptprn2P80560 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ptprn2P80560 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ptprn2P80560 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ptprn2P80560 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ptprn2P80560 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ptprn2P80560 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ptprn2P80560 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ptprn2P80560 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ptprn2P80560 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ptprn2P80560 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ptprn2P80560 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ptprn2P80560 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ptprn2P80560 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ptprn2P80560 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ptprn2P80560 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ptprn2P80560 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms