Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2-Q6P79568 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H2-Q6P79568 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2-Q6P79568 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2-Q6P79568 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2-Q6P79568 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
H2-Q6P79568 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2-Q6P79568 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2-Q6P79568 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2-Q6P79568 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
H2-Q6P79568 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2-Q6P79568 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2-Q6P79568 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2-Q6P79568 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2-Q6P79568 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H2-Q6P79568 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
H2-Q6P79568 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H2-Q6P79568 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H2-Q6P79568 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H2-Q6P79568 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H2-Q6P79568 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
H2-Q6P79568 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2-Q6P79568 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H2-Q6P79568 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H2-Q6P79568 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2-Q6P79568 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H2-Q6P79568 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2-Q6P79568 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H2-Q6P79568 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2-Q6P79568 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2-Q6P79568 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2-Q6P79568 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2-Q6P79568 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2-Q6P79568 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2-Q6P79568 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2-Q6P79568 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
H2-Q6P79568 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2-Q6P79568 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2-Q6P79568 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2-Q6P79568 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2-Q6P79568 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
H2-Q6P79568 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2-Q6P79568 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2-Q6P79568 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
H2-Q6P79568 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2-Q6P79568 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2-Q6P79568 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2-Q6P79568 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2-Q6P79568 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2-Q6P79568 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
H2-Q6P79568 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2-Q6P79568 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2-Q6P79568 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2-Q6P79568 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2-Q6P79568 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2-Q6P79568 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
H2-Q6P79568 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2-Q6P79568 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2-Q6P79568 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
H2-Q6P79568 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2-Q6P79568 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2-Q6P79568 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2-Q6P79568 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
H2-Q6P79568 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2-Q6P79568 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2-Q6P79568 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H2-Q6P79568 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H2-Q6P79568 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2-Q6P79568 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H2-Q6P79568 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2-Q6P79568 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2-Q6P79568 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H2-Q6P79568 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2-Q6P79568 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H2-Q6P79568 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2-Q6P79568 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2-Q6P79568 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2-Q6P79568 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2-Q6P79568 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H2-Q6P79568 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2-Q6P79568 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2-Q6P79568 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2-Q6P79568 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-Q6P79568 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-Q6P79568 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H2-Q6P79568 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H2-Q6P79568 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-Q6P79568 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-Q6P79568 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
H2-Q6P79568 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-Q6P79568 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-Q6P79568 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2-Q6P79568 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2-Q6P79568 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2-Q6P79568 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-Q6P79568 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q6P79568 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q6P79568 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2-Q6P79568 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H2-Q6P79568 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms