Protein–RNA interactions for Protein: P70436

Dlx4, Homeobox protein DLX-4, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx4P70436 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dlx4P70436 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dlx4P70436 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dlx4P70436 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dlx4P70436 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dlx4P70436 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dlx4P70436 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dlx4P70436 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dlx4P70436 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dlx4P70436 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dlx4P70436 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dlx4P70436 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dlx4P70436 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dlx4P70436 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dlx4P70436 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Dlx4P70436 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dlx4P70436 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dlx4P70436 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dlx4P70436 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Dlx4P70436 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Dlx4P70436 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dlx4P70436 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Dlx4P70436 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dlx4P70436 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Dlx4P70436 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Dlx4P70436 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dlx4P70436 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dlx4P70436 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dlx4P70436 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dlx4P70436 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dlx4P70436 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dlx4P70436 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dlx4P70436 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dlx4P70436 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dlx4P70436 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dlx4P70436 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dlx4P70436 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dlx4P70436 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dlx4P70436 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dlx4P70436 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dlx4P70436 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dlx4P70436 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dlx4P70436 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dlx4P70436 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dlx4P70436 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dlx4P70436 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dlx4P70436 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dlx4P70436 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Dlx4P70436 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dlx4P70436 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dlx4P70436 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dlx4P70436 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dlx4P70436 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dlx4P70436 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dlx4P70436 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dlx4P70436 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dlx4P70436 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dlx4P70436 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dlx4P70436 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dlx4P70436 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dlx4P70436 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dlx4P70436 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dlx4P70436 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Dlx4P70436 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dlx4P70436 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dlx4P70436 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dlx4P70436 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dlx4P70436 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dlx4P70436 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dlx4P70436 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dlx4P70436 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dlx4P70436 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dlx4P70436 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dlx4P70436 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dlx4P70436 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dlx4P70436 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dlx4P70436 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dlx4P70436 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dlx4P70436 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dlx4P70436 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dlx4P70436 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dlx4P70436 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dlx4P70436 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dlx4P70436 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Dlx4P70436 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dlx4P70436 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dlx4P70436 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dlx4P70436 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dlx4P70436 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dlx4P70436 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dlx4P70436 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dlx4P70436 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dlx4P70436 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Dlx4P70436 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dlx4P70436 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dlx4P70436 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Dlx4P70436 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dlx4P70436 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dlx4P70436 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dlx4P70436 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 411 ms