Protein–RNA interactions for Protein: P70436

Dlx4, Homeobox protein DLX-4, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx4P70436 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,6■■□□□ 1,37
Dlx4P70436 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Dlx4P70436 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Dlx4P70436 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Dlx4P70436 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Dlx4P70436 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Dlx4P70436 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Dlx4P70436 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Dlx4P70436 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Dlx4P70436 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,44■■□□□ 1,34
Dlx4P70436 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Dlx4P70436 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Dlx4P70436 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Dlx4P70436 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Dlx4P70436 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23,41■■□□□ 1,34
Dlx4P70436 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,41■■□□□ 1,34
Dlx4P70436 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Dlx4P70436 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Dlx4P70436 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23,36■■□□□ 1,33
Dlx4P70436 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,35■■□□□ 1,33
Dlx4P70436 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Dlx4P70436 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Dlx4P70436 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,32■■□□□ 1,32
Dlx4P70436 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,29■■□□□ 1,32
Dlx4P70436 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,28■■□□□ 1,32
Dlx4P70436 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Dlx4P70436 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Dlx4P70436 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Dlx4P70436 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Dlx4P70436 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Dlx4P70436 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Dlx4P70436 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Dlx4P70436 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Dlx4P70436 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Dlx4P70436 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Dlx4P70436 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Dlx4P70436 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,03■■□□□ 1,28
Dlx4P70436 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Dlx4P70436 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Dlx4P70436 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Dlx4P70436 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Dlx4P70436 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Dlx4P70436 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Dlx4P70436 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Dlx4P70436 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Dlx4P70436 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Dlx4P70436 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,9■■□□□ 1,26
Dlx4P70436 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Dlx4P70436 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Dlx4P70436 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Dlx4P70436 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Dlx4P70436 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Dlx4P70436 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Dlx4P70436 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Dlx4P70436 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Dlx4P70436 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22,84■■□□□ 1,25
Dlx4P70436 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Dlx4P70436 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Dlx4P70436 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Dlx4P70436 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22,82■■□□□ 1,24
Dlx4P70436 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Dlx4P70436 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Dlx4P70436 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22,77■■□□□ 1,24
Dlx4P70436 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Dlx4P70436 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Dlx4P70436 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Dlx4P70436 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,23
Dlx4P70436 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,67■■□□□ 1,22
Dlx4P70436 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Dlx4P70436 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Dlx4P70436 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Dlx4P70436 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,64■■□□□ 1,21
Dlx4P70436 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22,63■■□□□ 1,21
Dlx4P70436 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Dlx4P70436 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Dlx4P70436 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
Dlx4P70436 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,57■■□□□ 1,2
Dlx4P70436 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Dlx4P70436 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Dlx4P70436 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Dlx4P70436 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Dlx4P70436 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Dlx4P70436 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Dlx4P70436 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22,54■■□□□ 1,2
Dlx4P70436 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Dlx4P70436 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Dlx4P70436 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Dlx4P70436 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,5■■□□□ 1,19
Dlx4P70436 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Dlx4P70436 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Dlx4P70436 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
Dlx4P70436 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Dlx4P70436 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22,44■■□□□ 1,18
Dlx4P70436 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22,44■■□□□ 1,18
Dlx4P70436 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22,43■■□□□ 1,18
Dlx4P70436 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22,41■■□□□ 1,18
Dlx4P70436 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Dlx4P70436 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Dlx4P70436 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Dlx4P70436 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52,4 ms