Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NfixP70257 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NfixP70257 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NfixP70257 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
NfixP70257 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NfixP70257 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NfixP70257 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
NfixP70257 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
NfixP70257 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NfixP70257 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NfixP70257 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NfixP70257 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NfixP70257 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
NfixP70257 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NfixP70257 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NfixP70257 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NfixP70257 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NfixP70257 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NfixP70257 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NfixP70257 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NfixP70257 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NfixP70257 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NfixP70257 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NfixP70257 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NfixP70257 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.79■■■■□ 3
NfixP70257 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
NfixP70257 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NfixP70257 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NfixP70257 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NfixP70257 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
NfixP70257 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
NfixP70257 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NfixP70257 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NfixP70257 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NfixP70257 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NfixP70257 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NfixP70257 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NfixP70257 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NfixP70257 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NfixP70257 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NfixP70257 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NfixP70257 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NfixP70257 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NfixP70257 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NfixP70257 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
NfixP70257 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NfixP70257 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NfixP70257 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NfixP70257 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NfixP70257 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
NfixP70257 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NfixP70257 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NfixP70257 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NfixP70257 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NfixP70257 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NfixP70257 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NfixP70257 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NfixP70257 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NfixP70257 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NfixP70257 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NfixP70257 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NfixP70257 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NfixP70257 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NfixP70257 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NfixP70257 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
NfixP70257 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NfixP70257 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NfixP70257 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NfixP70257 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NfixP70257 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NfixP70257 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NfixP70257 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NfixP70257 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
NfixP70257 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NfixP70257 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NfixP70257 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NfixP70257 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
NfixP70257 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NfixP70257 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NfixP70257 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NfixP70257 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NfixP70257 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NfixP70257 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
NfixP70257 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NfixP70257 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NfixP70257 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NfixP70257 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NfixP70257 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NfixP70257 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NfixP70257 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NfixP70257 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NfixP70257 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
NfixP70257 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NfixP70257 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NfixP70257 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NfixP70257 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NfixP70257 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NfixP70257 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NfixP70257 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
NfixP70257 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms