Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34,49■■■■□ 3,11
NfixP70257 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
NfixP70257 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,45■■■■□ 3,11
NfixP70257 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34,45■■■■□ 3,1
NfixP70257 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,44■■■■□ 3,1
NfixP70257 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,41■■■■□ 3,1
NfixP70257 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,4■■■■□ 3,1
NfixP70257 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC34,37■■■■□ 3,09
NfixP70257 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,36■■■■□ 3,09
NfixP70257 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,34■■■■□ 3,09
NfixP70257 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
NfixP70257 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
NfixP70257 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34,32■■■■□ 3,08
NfixP70257 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,26■■■■□ 3,08
NfixP70257 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,22■■■■□ 3,07
NfixP70257 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
NfixP70257 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34,14■■■■□ 3,06
NfixP70257 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,05■■■■□ 3,04
NfixP70257 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
NfixP70257 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
NfixP70257 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3,03
NfixP70257 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
NfixP70257 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,87■■■■□ 3,01
NfixP70257 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
NfixP70257 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,79■■■■□ 3
NfixP70257 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
NfixP70257 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,72■■■□□ 2,99
NfixP70257 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,72■■■□□ 2,99
NfixP70257 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,71■■■□□ 2,99
NfixP70257 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,7■■■□□ 2,99
NfixP70257 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,98
NfixP70257 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
NfixP70257 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
NfixP70257 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,66■■■□□ 2,98
NfixP70257 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
NfixP70257 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33,62■■■□□ 2,97
NfixP70257 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
NfixP70257 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
NfixP70257 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
NfixP70257 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
NfixP70257 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,56■■■□□ 2,96
NfixP70257 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
NfixP70257 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
NfixP70257 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
NfixP70257 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,52■■■□□ 2,96
NfixP70257 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
NfixP70257 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC33,5■■■□□ 2,95
NfixP70257 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
NfixP70257 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,43■■■□□ 2,94
NfixP70257 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,93
NfixP70257 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
NfixP70257 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
NfixP70257 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
NfixP70257 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,29■■■□□ 2,92
NfixP70257 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
NfixP70257 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
NfixP70257 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
NfixP70257 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,26■■■□□ 2,92
NfixP70257 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC33,26■■■□□ 2,91
NfixP70257 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
NfixP70257 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
NfixP70257 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
NfixP70257 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
NfixP70257 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
NfixP70257 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC33,1■■■□□ 2,89
NfixP70257 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
NfixP70257 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,08■■■□□ 2,89
NfixP70257 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
NfixP70257 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,04■■■□□ 2,88
NfixP70257 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
NfixP70257 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
NfixP70257 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
NfixP70257 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32,95■■■□□ 2,87
NfixP70257 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32,94■■■□□ 2,86
NfixP70257 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
NfixP70257 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
NfixP70257 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32,89■■■□□ 2,86
NfixP70257 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
NfixP70257 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
NfixP70257 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
NfixP70257 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
NfixP70257 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,81■■■□□ 2,84
NfixP70257 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,8■■■□□ 2,84
NfixP70257 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
NfixP70257 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,76■■■□□ 2,83
NfixP70257 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
NfixP70257 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32,73■■■□□ 2,83
NfixP70257 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
NfixP70257 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
NfixP70257 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
NfixP70257 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32,71■■■□□ 2,83
NfixP70257 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32,69■■■□□ 2,82
NfixP70257 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,66■■■□□ 2,82
NfixP70257 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC32,65■■■□□ 2,82
NfixP70257 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC32,64■■■□□ 2,82
NfixP70257 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32,62■■■□□ 2,81
NfixP70257 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
NfixP70257 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,62■■■□□ 2,81
NfixP70257 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,6■■■□□ 2,81
NfixP70257 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,2 ms