Protein–RNA interactions for Protein: P70227

Itpr3, Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itpr3P70227 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itpr3P70227 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itpr3P70227 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Itpr3P70227 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itpr3P70227 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Itpr3P70227 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itpr3P70227 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Itpr3P70227 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itpr3P70227 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itpr3P70227 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itpr3P70227 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itpr3P70227 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itpr3P70227 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itpr3P70227 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itpr3P70227 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itpr3P70227 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itpr3P70227 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itpr3P70227 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itpr3P70227 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itpr3P70227 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Itpr3P70227 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itpr3P70227 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itpr3P70227 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Itpr3P70227 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itpr3P70227 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itpr3P70227 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itpr3P70227 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Itpr3P70227 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itpr3P70227 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itpr3P70227 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itpr3P70227 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itpr3P70227 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itpr3P70227 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itpr3P70227 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itpr3P70227 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itpr3P70227 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Itpr3P70227 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itpr3P70227 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itpr3P70227 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itpr3P70227 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itpr3P70227 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itpr3P70227 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itpr3P70227 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itpr3P70227 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itpr3P70227 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itpr3P70227 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itpr3P70227 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itpr3P70227 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itpr3P70227 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itpr3P70227 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Itpr3P70227 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itpr3P70227 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Itpr3P70227 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itpr3P70227 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itpr3P70227 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itpr3P70227 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itpr3P70227 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Itpr3P70227 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itpr3P70227 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itpr3P70227 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itpr3P70227 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itpr3P70227 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Itpr3P70227 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itpr3P70227 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itpr3P70227 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itpr3P70227 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itpr3P70227 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itpr3P70227 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itpr3P70227 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itpr3P70227 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itpr3P70227 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itpr3P70227 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Itpr3P70227 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itpr3P70227 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itpr3P70227 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itpr3P70227 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Itpr3P70227 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itpr3P70227 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Itpr3P70227 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itpr3P70227 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itpr3P70227 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Itpr3P70227 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Itpr3P70227 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itpr3P70227 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itpr3P70227 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itpr3P70227 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itpr3P70227 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Itpr3P70227 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itpr3P70227 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itpr3P70227 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Itpr3P70227 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itpr3P70227 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itpr3P70227 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itpr3P70227 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itpr3P70227 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itpr3P70227 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Itpr3P70227 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itpr3P70227 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Itpr3P70227 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Itpr3P70227 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms