Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tuba4aP68368 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tuba4aP68368 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tuba4aP68368 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Tuba4aP68368 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tuba4aP68368 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tuba4aP68368 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tuba4aP68368 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tuba4aP68368 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tuba4aP68368 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tuba4aP68368 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tuba4aP68368 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tuba4aP68368 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tuba4aP68368 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tuba4aP68368 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tuba4aP68368 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tuba4aP68368 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tuba4aP68368 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tuba4aP68368 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tuba4aP68368 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tuba4aP68368 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tuba4aP68368 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tuba4aP68368 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tuba4aP68368 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tuba4aP68368 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tuba4aP68368 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tuba4aP68368 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tuba4aP68368 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tuba4aP68368 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tuba4aP68368 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tuba4aP68368 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tuba4aP68368 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tuba4aP68368 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tuba4aP68368 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tuba4aP68368 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tuba4aP68368 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tuba4aP68368 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tuba4aP68368 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tuba4aP68368 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tuba4aP68368 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tuba4aP68368 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tuba4aP68368 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tuba4aP68368 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tuba4aP68368 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tuba4aP68368 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tuba4aP68368 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tuba4aP68368 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tuba4aP68368 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tuba4aP68368 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tuba4aP68368 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tuba4aP68368 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tuba4aP68368 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tuba4aP68368 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tuba4aP68368 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tuba4aP68368 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tuba4aP68368 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tuba4aP68368 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tuba4aP68368 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tuba4aP68368 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tuba4aP68368 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tuba4aP68368 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tuba4aP68368 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tuba4aP68368 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tuba4aP68368 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tuba4aP68368 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tuba4aP68368 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tuba4aP68368 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tuba4aP68368 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tuba4aP68368 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tuba4aP68368 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tuba4aP68368 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tuba4aP68368 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tuba4aP68368 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tuba4aP68368 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tuba4aP68368 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tuba4aP68368 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tuba4aP68368 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tuba4aP68368 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tuba4aP68368 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tuba4aP68368 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tuba4aP68368 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tuba4aP68368 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tuba4aP68368 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tuba4aP68368 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tuba4aP68368 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tuba4aP68368 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tuba4aP68368 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tuba4aP68368 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tuba4aP68368 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tuba4aP68368 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tuba4aP68368 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tuba4aP68368 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tuba4aP68368 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tuba4aP68368 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tuba4aP68368 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tuba4aP68368 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tuba4aP68368 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tuba4aP68368 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tuba4aP68368 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tuba4aP68368 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms