Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rps27aP62983 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rps27aP62983 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps27aP62983 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rps27aP62983 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rps27aP62983 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps27aP62983 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps27aP62983 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps27aP62983 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps27aP62983 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps27aP62983 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps27aP62983 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps27aP62983 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps27aP62983 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps27aP62983 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps27aP62983 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps27aP62983 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rps27aP62983 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rps27aP62983 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps27aP62983 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rps27aP62983 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rps27aP62983 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps27aP62983 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rps27aP62983 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps27aP62983 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps27aP62983 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rps27aP62983 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rps27aP62983 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps27aP62983 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rps27aP62983 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rps27aP62983 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rps27aP62983 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rps27aP62983 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rps27aP62983 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rps27aP62983 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rps27aP62983 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rps27aP62983 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps27aP62983 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rps27aP62983 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rps27aP62983 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rps27aP62983 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rps27aP62983 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rps27aP62983 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rps27aP62983 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rps27aP62983 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps27aP62983 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rps27aP62983 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rps27aP62983 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rps27aP62983 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps27aP62983 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rps27aP62983 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rps27aP62983 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rps27aP62983 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rps27aP62983 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rps27aP62983 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps27aP62983 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rps27aP62983 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rps27aP62983 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps27aP62983 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rps27aP62983 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Rps27aP62983 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps27aP62983 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rps27aP62983 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps27aP62983 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rps27aP62983 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rps27aP62983 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps27aP62983 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rps27aP62983 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps27aP62983 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps27aP62983 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rps27aP62983 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rps27aP62983 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rps27aP62983 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps27aP62983 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps27aP62983 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rps27aP62983 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rps27aP62983 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rps27aP62983 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps27aP62983 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rps27aP62983 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps27aP62983 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rps27aP62983 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps27aP62983 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rps27aP62983 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps27aP62983 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps27aP62983 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps27aP62983 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rps27aP62983 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps27aP62983 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rps27aP62983 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps27aP62983 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rps27aP62983 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps27aP62983 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps27aP62983 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rps27aP62983 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rps27aP62983 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps27aP62983 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rps27aP62983 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rps27aP62983 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rps27aP62983 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms