Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Ap1s1P61967 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Ap1s1P61967 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ap1s1P61967 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Ap1s1P61967 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Ap1s1P61967 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Ap1s1P61967 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Ap1s1P61967 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Ap1s1P61967 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ap1s1P61967 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Ap1s1P61967 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
Ap1s1P61967 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ap1s1P61967 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Ap1s1P61967 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Ap1s1P61967 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ap1s1P61967 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Ap1s1P61967 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ap1s1P61967 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ap1s1P61967 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ap1s1P61967 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,64■■■□□ 2,02
Ap1s1P61967 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Ap1s1P61967 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ap1s1P61967 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ap1s1P61967 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Ap1s1P61967 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ap1s1P61967 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ap1s1P61967 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ap1s1P61967 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Ap1s1P61967 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ap1s1P61967 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Ap1s1P61967 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Ap1s1P61967 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,45■■□□□ 1,98
Ap1s1P61967 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Ap1s1P61967 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ap1s1P61967 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,38■■□□□ 1,97
Ap1s1P61967 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ap1s1P61967 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,37■■□□□ 1,97
Ap1s1P61967 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Ap1s1P61967 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Ap1s1P61967 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
Ap1s1P61967 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,32■■□□□ 1,96
Ap1s1P61967 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Ap1s1P61967 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ap1s1P61967 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Ap1s1P61967 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ap1s1P61967 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Ap1s1P61967 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,19■■□□□ 1,94
Ap1s1P61967 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ap1s1P61967 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ap1s1P61967 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ap1s1P61967 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Ap1s1P61967 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Ap1s1P61967 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Ap1s1P61967 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,93
Ap1s1P61967 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Ap1s1P61967 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Ap1s1P61967 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Ap1s1P61967 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ap1s1P61967 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ap1s1P61967 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ap1s1P61967 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Ap1s1P61967 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Ap1s1P61967 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ap1s1P61967 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ap1s1P61967 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Ap1s1P61967 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Ap1s1P61967 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ap1s1P61967 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ap1s1P61967 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Ap1s1P61967 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ap1s1P61967 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ap1s1P61967 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ap1s1P61967 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ap1s1P61967 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ap1s1P61967 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ap1s1P61967 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ap1s1P61967 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ap1s1P61967 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ap1s1P61967 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ap1s1P61967 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Ap1s1P61967 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ap1s1P61967 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ap1s1P61967 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ap1s1P61967 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Ap1s1P61967 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Ap1s1P61967 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Ap1s1P61967 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
Ap1s1P61967 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ap1s1P61967 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ap1s1P61967 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,84
Ap1s1P61967 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,56■■□□□ 1,84
Ap1s1P61967 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Ap1s1P61967 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Ap1s1P61967 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Ap1s1P61967 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Ap1s1P61967 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Ap1s1P61967 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Ap1s1P61967 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Ap1s1P61967 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Ap1s1P61967 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms