Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk5r1P61809 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk5r1P61809 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk5r1P61809 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk5r1P61809 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cdk5r1P61809 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5r1P61809 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk5r1P61809 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cdk5r1P61809 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk5r1P61809 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk5r1P61809 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk5r1P61809 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk5r1P61809 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdk5r1P61809 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdk5r1P61809 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdk5r1P61809 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5r1P61809 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5r1P61809 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdk5r1P61809 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdk5r1P61809 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdk5r1P61809 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5r1P61809 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdk5r1P61809 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk5r1P61809 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdk5r1P61809 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdk5r1P61809 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdk5r1P61809 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdk5r1P61809 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk5r1P61809 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5r1P61809 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdk5r1P61809 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk5r1P61809 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk5r1P61809 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5r1P61809 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk5r1P61809 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk5r1P61809 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk5r1P61809 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk5r1P61809 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5r1P61809 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk5r1P61809 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk5r1P61809 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk5r1P61809 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk5r1P61809 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk5r1P61809 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk5r1P61809 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5r1P61809 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5r1P61809 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk5r1P61809 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk5r1P61809 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk5r1P61809 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk5r1P61809 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5r1P61809 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk5r1P61809 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk5r1P61809 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk5r1P61809 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdk5r1P61809 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdk5r1P61809 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdk5r1P61809 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdk5r1P61809 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5r1P61809 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdk5r1P61809 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5r1P61809 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdk5r1P61809 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cdk5r1P61809 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdk5r1P61809 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5r1P61809 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5r1P61809 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdk5r1P61809 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdk5r1P61809 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5r1P61809 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5r1P61809 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdk5r1P61809 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5r1P61809 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5r1P61809 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk5r1P61809 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5r1P61809 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5r1P61809 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5r1P61809 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5r1P61809 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5r1P61809 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdk5r1P61809 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdk5r1P61809 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5r1P61809 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5r1P61809 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdk5r1P61809 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdk5r1P61809 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5r1P61809 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5r1P61809 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdk5r1P61809 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdk5r1P61809 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdk5r1P61809 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk5r1P61809 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdk5r1P61809 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdk5r1P61809 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdk5r1P61809 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk5r1P61809 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdk5r1P61809 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdk5r1P61809 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk5r1P61809 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdk5r1P61809 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms