Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
SnnP61807 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
SnnP61807 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
SnnP61807 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
SnnP61807 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
SnnP61807 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
SnnP61807 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
SnnP61807 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,97■■□□□ 1,91
SnnP61807 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
SnnP61807 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
SnnP61807 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
SnnP61807 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
SnnP61807 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
SnnP61807 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
SnnP61807 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,83■■□□□ 1,89
SnnP61807 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
SnnP61807 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,73■■□□□ 1,87
SnnP61807 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
SnnP61807 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
SnnP61807 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
SnnP61807 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
SnnP61807 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,85
SnnP61807 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
SnnP61807 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
SnnP61807 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
SnnP61807 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,6■■□□□ 1,85
SnnP61807 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,59■■□□□ 1,85
SnnP61807 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
SnnP61807 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
SnnP61807 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
SnnP61807 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,51■■□□□ 1,83
SnnP61807 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
SnnP61807 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
SnnP61807 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
SnnP61807 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,46■■□□□ 1,83
SnnP61807 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
SnnP61807 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
SnnP61807 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
SnnP61807 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
SnnP61807 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,41■■□□□ 1,82
SnnP61807 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,4■■□□□ 1,82
SnnP61807 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,39■■□□□ 1,82
SnnP61807 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
SnnP61807 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
SnnP61807 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,34■■□□□ 1,81
SnnP61807 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
SnnP61807 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
SnnP61807 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,31■■□□□ 1,8
SnnP61807 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
SnnP61807 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
SnnP61807 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
SnnP61807 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
SnnP61807 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
SnnP61807 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
SnnP61807 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
SnnP61807 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,19■■□□□ 1,78
SnnP61807 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
SnnP61807 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,17■■□□□ 1,78
SnnP61807 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
SnnP61807 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
SnnP61807 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
SnnP61807 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
SnnP61807 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
SnnP61807 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
SnnP61807 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,07■■□□□ 1,76
SnnP61807 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
SnnP61807 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
SnnP61807 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,05■■□□□ 1,76
SnnP61807 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
SnnP61807 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
SnnP61807 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
SnnP61807 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
SnnP61807 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
SnnP61807 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
SnnP61807 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,92■■□□□ 1,74
SnnP61807 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
SnnP61807 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
SnnP61807 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
SnnP61807 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
SnnP61807 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
SnnP61807 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
SnnP61807 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
SnnP61807 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
SnnP61807 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
SnnP61807 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
SnnP61807 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,73
SnnP61807 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
SnnP61807 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
SnnP61807 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
SnnP61807 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
SnnP61807 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
SnnP61807 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
SnnP61807 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25,76■■□□□ 1,71
SnnP61807 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,76■■□□□ 1,71
SnnP61807 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,75■■□□□ 1,71
SnnP61807 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
SnnP61807 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
SnnP61807 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
SnnP61807 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
SnnP61807 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms