Protein–RNA interactions for Protein: P61211

Arl1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl1P61211 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Arl1P61211 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Arl1P61211 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Arl1P61211 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Arl1P61211 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Arl1P61211 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Arl1P61211 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Arl1P61211 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Arl1P61211 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Arl1P61211 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Arl1P61211 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Arl1P61211 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Arl1P61211 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Arl1P61211 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Arl1P61211 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Arl1P61211 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Arl1P61211 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Arl1P61211 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Arl1P61211 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Arl1P61211 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Arl1P61211 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Arl1P61211 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Arl1P61211 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Arl1P61211 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Arl1P61211 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Arl1P61211 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Arl1P61211 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Arl1P61211 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Arl1P61211 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Arl1P61211 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Arl1P61211 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Arl1P61211 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arl1P61211 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arl1P61211 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Arl1P61211 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Arl1P61211 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Arl1P61211 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Arl1P61211 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Arl1P61211 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Arl1P61211 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Arl1P61211 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Arl1P61211 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Arl1P61211 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Arl1P61211 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Arl1P61211 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Arl1P61211 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arl1P61211 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Arl1P61211 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arl1P61211 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arl1P61211 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arl1P61211 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arl1P61211 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Arl1P61211 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arl1P61211 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arl1P61211 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Arl1P61211 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arl1P61211 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arl1P61211 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arl1P61211 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Arl1P61211 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arl1P61211 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arl1P61211 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arl1P61211 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arl1P61211 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arl1P61211 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Arl1P61211 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arl1P61211 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arl1P61211 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arl1P61211 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arl1P61211 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arl1P61211 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Arl1P61211 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Arl1P61211 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arl1P61211 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Arl1P61211 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Arl1P61211 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Arl1P61211 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arl1P61211 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Arl1P61211 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arl1P61211 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arl1P61211 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arl1P61211 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Arl1P61211 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Arl1P61211 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Arl1P61211 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Arl1P61211 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Arl1P61211 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Arl1P61211 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Arl1P61211 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arl1P61211 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Arl1P61211 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arl1P61211 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Arl1P61211 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Arl1P61211 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arl1P61211 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arl1P61211 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Arl1P61211 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Arl1P61211 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Arl1P61211 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Arl1P61211 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms