Protein–RNA interactions for Protein: P60843

Eif4a1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4a1P60843 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Eif4a1P60843 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Eif4a1P60843 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Eif4a1P60843 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Eif4a1P60843 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Eif4a1P60843 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Eif4a1P60843 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Eif4a1P60843 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Eif4a1P60843 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Eif4a1P60843 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Eif4a1P60843 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
Eif4a1P60843 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Eif4a1P60843 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Eif4a1P60843 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Eif4a1P60843 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Eif4a1P60843 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Eif4a1P60843 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Eif4a1P60843 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Eif4a1P60843 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Eif4a1P60843 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Eif4a1P60843 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Eif4a1P60843 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Eif4a1P60843 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Eif4a1P60843 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Eif4a1P60843 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Eif4a1P60843 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Eif4a1P60843 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Eif4a1P60843 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Eif4a1P60843 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Eif4a1P60843 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Eif4a1P60843 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Eif4a1P60843 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Eif4a1P60843 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Eif4a1P60843 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Eif4a1P60843 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Eif4a1P60843 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Eif4a1P60843 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Eif4a1P60843 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Eif4a1P60843 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Eif4a1P60843 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Eif4a1P60843 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Eif4a1P60843 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Eif4a1P60843 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Eif4a1P60843 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Eif4a1P60843 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Eif4a1P60843 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Eif4a1P60843 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Eif4a1P60843 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Eif4a1P60843 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Eif4a1P60843 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Eif4a1P60843 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Eif4a1P60843 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Eif4a1P60843 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Eif4a1P60843 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Eif4a1P60843 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Eif4a1P60843 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Eif4a1P60843 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Eif4a1P60843 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Eif4a1P60843 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Eif4a1P60843 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Eif4a1P60843 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Eif4a1P60843 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Eif4a1P60843 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Eif4a1P60843 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Eif4a1P60843 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Eif4a1P60843 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Eif4a1P60843 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Eif4a1P60843 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Eif4a1P60843 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Eif4a1P60843 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Eif4a1P60843 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Eif4a1P60843 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Eif4a1P60843 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Eif4a1P60843 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Eif4a1P60843 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Eif4a1P60843 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Eif4a1P60843 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Eif4a1P60843 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Eif4a1P60843 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Eif4a1P60843 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Eif4a1P60843 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Eif4a1P60843 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Eif4a1P60843 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Eif4a1P60843 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Eif4a1P60843 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Eif4a1P60843 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Eif4a1P60843 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Eif4a1P60843 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Eif4a1P60843 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Eif4a1P60843 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Eif4a1P60843 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Eif4a1P60843 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Eif4a1P60843 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Eif4a1P60843 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Eif4a1P60843 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Eif4a1P60843 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Eif4a1P60843 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Eif4a1P60843 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Eif4a1P60843 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Eif4a1P60843 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms