Protein–RNA interactions for Protein: P59999

Arpc4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc4P59999 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arpc4P59999 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arpc4P59999 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arpc4P59999 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arpc4P59999 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arpc4P59999 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arpc4P59999 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arpc4P59999 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arpc4P59999 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arpc4P59999 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arpc4P59999 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Arpc4P59999 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Arpc4P59999 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arpc4P59999 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arpc4P59999 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Arpc4P59999 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Arpc4P59999 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Arpc4P59999 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Arpc4P59999 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arpc4P59999 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arpc4P59999 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Arpc4P59999 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arpc4P59999 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arpc4P59999 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arpc4P59999 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Arpc4P59999 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arpc4P59999 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arpc4P59999 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arpc4P59999 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arpc4P59999 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arpc4P59999 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arpc4P59999 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arpc4P59999 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arpc4P59999 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arpc4P59999 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arpc4P59999 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Arpc4P59999 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arpc4P59999 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arpc4P59999 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arpc4P59999 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arpc4P59999 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arpc4P59999 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arpc4P59999 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arpc4P59999 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Arpc4P59999 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Arpc4P59999 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arpc4P59999 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arpc4P59999 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arpc4P59999 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arpc4P59999 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arpc4P59999 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arpc4P59999 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Arpc4P59999 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arpc4P59999 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arpc4P59999 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arpc4P59999 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Arpc4P59999 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arpc4P59999 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arpc4P59999 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arpc4P59999 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arpc4P59999 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arpc4P59999 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arpc4P59999 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arpc4P59999 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arpc4P59999 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arpc4P59999 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arpc4P59999 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Arpc4P59999 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arpc4P59999 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arpc4P59999 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arpc4P59999 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arpc4P59999 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arpc4P59999 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arpc4P59999 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arpc4P59999 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arpc4P59999 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arpc4P59999 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Arpc4P59999 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arpc4P59999 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arpc4P59999 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arpc4P59999 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arpc4P59999 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arpc4P59999 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arpc4P59999 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arpc4P59999 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arpc4P59999 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Arpc4P59999 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arpc4P59999 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arpc4P59999 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arpc4P59999 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arpc4P59999 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arpc4P59999 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arpc4P59999 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arpc4P59999 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arpc4P59999 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arpc4P59999 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arpc4P59999 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arpc4P59999 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arpc4P59999 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Arpc4P59999 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms