Protein–RNA interactions for Protein: P59759

Mkl2, MKL/myocardin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl2P59759 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Mkl2P59759 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Mkl2P59759 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Mkl2P59759 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Mkl2P59759 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Mkl2P59759 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Mkl2P59759 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Mkl2P59759 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Mkl2P59759 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,46■■■□□ 2,31
Mkl2P59759 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Mkl2P59759 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Mkl2P59759 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Mkl2P59759 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Mkl2P59759 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Mkl2P59759 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Mkl2P59759 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Mkl2P59759 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Mkl2P59759 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Mkl2P59759 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Mkl2P59759 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Mkl2P59759 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Mkl2P59759 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Mkl2P59759 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Mkl2P59759 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Mkl2P59759 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Mkl2P59759 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Mkl2P59759 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Mkl2P59759 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Mkl2P59759 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Mkl2P59759 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Mkl2P59759 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Mkl2P59759 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Mkl2P59759 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Mkl2P59759 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Mkl2P59759 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Mkl2P59759 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Mkl2P59759 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Mkl2P59759 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Mkl2P59759 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28,81■■■□□ 2,2
Mkl2P59759 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Mkl2P59759 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Mkl2P59759 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Mkl2P59759 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,72■■■□□ 2,19
Mkl2P59759 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Mkl2P59759 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Mkl2P59759 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28,7■■■□□ 2,18
Mkl2P59759 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,69■■■□□ 2,18
Mkl2P59759 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Mkl2P59759 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Mkl2P59759 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Mkl2P59759 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Mkl2P59759 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Mkl2P59759 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Mkl2P59759 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Mkl2P59759 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,16
Mkl2P59759 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Mkl2P59759 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Mkl2P59759 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Mkl2P59759 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Mkl2P59759 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Mkl2P59759 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Mkl2P59759 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Mkl2P59759 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Mkl2P59759 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Mkl2P59759 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Mkl2P59759 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Mkl2P59759 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Mkl2P59759 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Mkl2P59759 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Mkl2P59759 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Mkl2P59759 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,39■■■□□ 2,14
Mkl2P59759 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Mkl2P59759 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Mkl2P59759 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Mkl2P59759 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Mkl2P59759 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Mkl2P59759 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,34■■■□□ 2,13
Mkl2P59759 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Mkl2P59759 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Mkl2P59759 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Mkl2P59759 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Mkl2P59759 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Mkl2P59759 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Mkl2P59759 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Mkl2P59759 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Mkl2P59759 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Mkl2P59759 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Mkl2P59759 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Mkl2P59759 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,2■■■□□ 2,1
Mkl2P59759 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Mkl2P59759 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Mkl2P59759 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Mkl2P59759 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Mkl2P59759 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Mkl2P59759 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Mkl2P59759 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Mkl2P59759 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Mkl2P59759 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Mkl2P59759 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Mkl2P59759 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28,06■■■□□ 2,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms