Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdf1P59326 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdf1P59326 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdf1P59326 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdf1P59326 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ythdf1P59326 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ythdf1P59326 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ythdf1P59326 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdf1P59326 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdf1P59326 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ythdf1P59326 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ythdf1P59326 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ythdf1P59326 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ythdf1P59326 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ythdf1P59326 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ythdf1P59326 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ythdf1P59326 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ythdf1P59326 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ythdf1P59326 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ythdf1P59326 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ythdf1P59326 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ythdf1P59326 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdf1P59326 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ythdf1P59326 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdf1P59326 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ythdf1P59326 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ythdf1P59326 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdf1P59326 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ythdf1P59326 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ythdf1P59326 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ythdf1P59326 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ythdf1P59326 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ythdf1P59326 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ythdf1P59326 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdf1P59326 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ythdf1P59326 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ythdf1P59326 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdf1P59326 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdf1P59326 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ythdf1P59326 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ythdf1P59326 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdf1P59326 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ythdf1P59326 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ythdf1P59326 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ythdf1P59326 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ythdf1P59326 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ythdf1P59326 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ythdf1P59326 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ythdf1P59326 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdf1P59326 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdf1P59326 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ythdf1P59326 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdf1P59326 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ythdf1P59326 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ythdf1P59326 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ythdf1P59326 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdf1P59326 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ythdf1P59326 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ythdf1P59326 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ythdf1P59326 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdf1P59326 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ythdf1P59326 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ythdf1P59326 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ythdf1P59326 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ythdf1P59326 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ythdf1P59326 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ythdf1P59326 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdf1P59326 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ythdf1P59326 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ythdf1P59326 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdf1P59326 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdf1P59326 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ythdf1P59326 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ythdf1P59326 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdf1P59326 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ythdf1P59326 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ythdf1P59326 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ythdf1P59326 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ythdf1P59326 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdf1P59326 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ythdf1P59326 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdf1P59326 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ythdf1P59326 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdf1P59326 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ythdf1P59326 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ythdf1P59326 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ythdf1P59326 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ythdf1P59326 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdf1P59326 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ythdf1P59326 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ythdf1P59326 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ythdf1P59326 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdf1P59326 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ythdf1P59326 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ythdf1P59326 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdf1P59326 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ythdf1P59326 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ythdf1P59326 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ythdf1P59326 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ythdf1P59326 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms