Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctdsp1P58466 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctdsp1P58466 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctdsp1P58466 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctdsp1P58466 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctdsp1P58466 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctdsp1P58466 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctdsp1P58466 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdsp1P58466 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdsp1P58466 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdsp1P58466 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdsp1P58466 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdsp1P58466 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdsp1P58466 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdsp1P58466 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctdsp1P58466 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ctdsp1P58466 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ctdsp1P58466 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdsp1P58466 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdsp1P58466 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdsp1P58466 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ctdsp1P58466 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ctdsp1P58466 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdsp1P58466 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ctdsp1P58466 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ctdsp1P58466 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdsp1P58466 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdsp1P58466 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdsp1P58466 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ctdsp1P58466 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctdsp1P58466 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ctdsp1P58466 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdsp1P58466 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ctdsp1P58466 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ctdsp1P58466 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ctdsp1P58466 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctdsp1P58466 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ctdsp1P58466 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdsp1P58466 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ctdsp1P58466 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ctdsp1P58466 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ctdsp1P58466 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ctdsp1P58466 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ctdsp1P58466 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ctdsp1P58466 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctdsp1P58466 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ctdsp1P58466 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ctdsp1P58466 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctdsp1P58466 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ctdsp1P58466 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ctdsp1P58466 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ctdsp1P58466 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ctdsp1P58466 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ctdsp1P58466 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctdsp1P58466 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctdsp1P58466 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ctdsp1P58466 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctdsp1P58466 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ctdsp1P58466 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ctdsp1P58466 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ctdsp1P58466 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ctdsp1P58466 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctdsp1P58466 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ctdsp1P58466 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ctdsp1P58466 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctdsp1P58466 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctdsp1P58466 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctdsp1P58466 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp1P58466 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctdsp1P58466 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp1P58466 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctdsp1P58466 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ctdsp1P58466 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ctdsp1P58466 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ctdsp1P58466 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdsp1P58466 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ctdsp1P58466 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdsp1P58466 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ctdsp1P58466 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp1P58466 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ctdsp1P58466 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ctdsp1P58466 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdsp1P58466 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ctdsp1P58466 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ctdsp1P58466 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp1P58466 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp1P58466 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ctdsp1P58466 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdsp1P58466 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdsp1P58466 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdsp1P58466 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ctdsp1P58466 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ctdsp1P58466 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdsp1P58466 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ctdsp1P58466 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ctdsp1P58466 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ctdsp1P58466 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ctdsp1P58466 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ctdsp1P58466 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ctdsp1P58466 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms