Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,78■■□□□ 1,4
CtdsplP58465 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
CtdsplP58465 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
CtdsplP58465 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,7■■□□□ 1,38
CtdsplP58465 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,62■■□□□ 1,37
CtdsplP58465 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
CtdsplP58465 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
CtdsplP58465 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
CtdsplP58465 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
CtdsplP58465 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
CtdsplP58465 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
CtdsplP58465 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
CtdsplP58465 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,35
CtdsplP58465 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,42■■□□□ 1,34
CtdsplP58465 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,4■■□□□ 1,34
CtdsplP58465 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
CtdsplP58465 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
CtdsplP58465 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,36■■□□□ 1,33
CtdsplP58465 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
CtdsplP58465 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
CtdsplP58465 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23,33■■□□□ 1,32
CtdsplP58465 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,31■■□□□ 1,32
CtdsplP58465 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
CtdsplP58465 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
CtdsplP58465 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
CtdsplP58465 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
CtdsplP58465 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
CtdsplP58465 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
CtdsplP58465 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
CtdsplP58465 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
CtdsplP58465 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
CtdsplP58465 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
CtdsplP58465 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,11■■□□□ 1,29
CtdsplP58465 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
CtdsplP58465 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
CtdsplP58465 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
CtdsplP58465 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
CtdsplP58465 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
CtdsplP58465 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
CtdsplP58465 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
CtdsplP58465 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
CtdsplP58465 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
CtdsplP58465 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
CtdsplP58465 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22,99■■□□□ 1,27
CtdsplP58465 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
CtdsplP58465 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
CtdsplP58465 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
CtdsplP58465 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22,91■■□□□ 1,26
CtdsplP58465 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
CtdsplP58465 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
CtdsplP58465 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,89■■□□□ 1,25
CtdsplP58465 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
CtdsplP58465 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
CtdsplP58465 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
CtdsplP58465 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
CtdsplP58465 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
CtdsplP58465 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,86■■□□□ 1,25
CtdsplP58465 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,85■■□□□ 1,25
CtdsplP58465 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22,84■■□□□ 1,25
CtdsplP58465 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
CtdsplP58465 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
CtdsplP58465 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
CtdsplP58465 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
CtdsplP58465 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
CtdsplP58465 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
CtdsplP58465 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
CtdsplP58465 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22,76■■□□□ 1,23
CtdsplP58465 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
CtdsplP58465 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,75■■□□□ 1,23
CtdsplP58465 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
CtdsplP58465 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
CtdsplP58465 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
CtdsplP58465 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
CtdsplP58465 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
CtdsplP58465 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22,71■■□□□ 1,23
CtdsplP58465 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
CtdsplP58465 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22,67■■□□□ 1,22
CtdsplP58465 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
CtdsplP58465 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
CtdsplP58465 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
CtdsplP58465 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
CtdsplP58465 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
CtdsplP58465 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
CtdsplP58465 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,64■■□□□ 1,21
CtdsplP58465 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
CtdsplP58465 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
CtdsplP58465 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
CtdsplP58465 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,61■■□□□ 1,21
CtdsplP58465 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
CtdsplP58465 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,21
CtdsplP58465 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,58■■□□□ 1,2
CtdsplP58465 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
CtdsplP58465 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
CtdsplP58465 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
CtdsplP58465 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
CtdsplP58465 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22,53■■□□□ 1,2
CtdsplP58465 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
CtdsplP58465 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,5■■□□□ 1,19
CtdsplP58465 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
CtdsplP58465 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,5 ms