Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Samsn1P57725 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Samsn1P57725 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Samsn1P57725 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Samsn1P57725 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Samsn1P57725 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Samsn1P57725 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Samsn1P57725 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Samsn1P57725 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Samsn1P57725 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Samsn1P57725 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Samsn1P57725 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Samsn1P57725 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Samsn1P57725 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Samsn1P57725 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Samsn1P57725 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Samsn1P57725 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Samsn1P57725 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Samsn1P57725 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Samsn1P57725 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Samsn1P57725 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Samsn1P57725 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Samsn1P57725 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Samsn1P57725 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Samsn1P57725 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Samsn1P57725 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Samsn1P57725 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Samsn1P57725 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Samsn1P57725 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Samsn1P57725 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Samsn1P57725 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Samsn1P57725 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Samsn1P57725 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Samsn1P57725 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Samsn1P57725 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Samsn1P57725 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Samsn1P57725 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Samsn1P57725 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Samsn1P57725 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Samsn1P57725 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Samsn1P57725 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Samsn1P57725 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Samsn1P57725 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Samsn1P57725 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Samsn1P57725 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Samsn1P57725 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Samsn1P57725 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Samsn1P57725 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Samsn1P57725 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Samsn1P57725 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Samsn1P57725 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Samsn1P57725 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Samsn1P57725 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Samsn1P57725 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Samsn1P57725 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Samsn1P57725 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Samsn1P57725 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Samsn1P57725 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Samsn1P57725 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Samsn1P57725 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Samsn1P57725 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Samsn1P57725 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Samsn1P57725 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Samsn1P57725 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Samsn1P57725 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Samsn1P57725 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Samsn1P57725 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Samsn1P57725 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Samsn1P57725 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Samsn1P57725 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Samsn1P57725 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Samsn1P57725 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Samsn1P57725 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Samsn1P57725 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Samsn1P57725 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Samsn1P57725 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Samsn1P57725 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Samsn1P57725 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Samsn1P57725 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Samsn1P57725 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Samsn1P57725 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Samsn1P57725 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Samsn1P57725 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Samsn1P57725 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Samsn1P57725 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Samsn1P57725 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Samsn1P57725 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Samsn1P57725 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Samsn1P57725 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Samsn1P57725 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Samsn1P57725 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Samsn1P57725 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Samsn1P57725 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Samsn1P57725 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Samsn1P57725 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Samsn1P57725 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Samsn1P57725 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Samsn1P57725 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Samsn1P57725 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Samsn1P57725 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms