Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Usp25P57080 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Usp25P57080 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Usp25P57080 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,95■■■□□ 2,55
Usp25P57080 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,54
Usp25P57080 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Usp25P57080 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Usp25P57080 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Usp25P57080 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30,87■■■□□ 2,53
Usp25P57080 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Usp25P57080 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,8■■■□□ 2,52
Usp25P57080 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Usp25P57080 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Usp25P57080 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,7■■■□□ 2,5
Usp25P57080 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Usp25P57080 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,69■■■□□ 2,5
Usp25P57080 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Usp25P57080 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30,69■■■□□ 2,5
Usp25P57080 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,67■■■□□ 2,5
Usp25P57080 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Usp25P57080 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,64■■■□□ 2,5
Usp25P57080 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30,64■■■□□ 2,5
Usp25P57080 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Usp25P57080 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Usp25P57080 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Usp25P57080 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Usp25P57080 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Usp25P57080 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Usp25P57080 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Usp25P57080 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Usp25P57080 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30,37■■■□□ 2,45
Usp25P57080 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Usp25P57080 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Usp25P57080 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Usp25P57080 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Usp25P57080 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Usp25P57080 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Usp25P57080 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Usp25P57080 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Usp25P57080 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Usp25P57080 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Usp25P57080 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Usp25P57080 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30,2■■■□□ 2,42
Usp25P57080 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Usp25P57080 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Usp25P57080 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Usp25P57080 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Usp25P57080 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Usp25P57080 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Usp25P57080 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30,11■■■□□ 2,41
Usp25P57080 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Usp25P57080 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Usp25P57080 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Usp25P57080 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Usp25P57080 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Usp25P57080 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Usp25P57080 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Usp25P57080 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Usp25P57080 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Usp25P57080 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Usp25P57080 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Usp25P57080 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Usp25P57080 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Usp25P57080 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Usp25P57080 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Usp25P57080 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Usp25P57080 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Usp25P57080 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,83■■■□□ 2,37
Usp25P57080 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,8■■■□□ 2,36
Usp25P57080 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Usp25P57080 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Usp25P57080 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Usp25P57080 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,74■■■□□ 2,35
Usp25P57080 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Usp25P57080 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Usp25P57080 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Usp25P57080 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Usp25P57080 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Usp25P57080 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Usp25P57080 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Usp25P57080 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29,69■■■□□ 2,34
Usp25P57080 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Usp25P57080 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Usp25P57080 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Usp25P57080 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Usp25P57080 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Usp25P57080 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Usp25P57080 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Usp25P57080 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Usp25P57080 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Usp25P57080 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Usp25P57080 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Usp25P57080 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Usp25P57080 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Usp25P57080 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Usp25P57080 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,5■■■□□ 2,31
Usp25P57080 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Usp25P57080 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Usp25P57080 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Usp25P57080 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,1 ms