Protein–RNA interactions for Protein: P57016

Lad1, Ladinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lad1P57016 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lad1P57016 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lad1P57016 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lad1P57016 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lad1P57016 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lad1P57016 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lad1P57016 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lad1P57016 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lad1P57016 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lad1P57016 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lad1P57016 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lad1P57016 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lad1P57016 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lad1P57016 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lad1P57016 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lad1P57016 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lad1P57016 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lad1P57016 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lad1P57016 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lad1P57016 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lad1P57016 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lad1P57016 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lad1P57016 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lad1P57016 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lad1P57016 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lad1P57016 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lad1P57016 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lad1P57016 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lad1P57016 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lad1P57016 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lad1P57016 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lad1P57016 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lad1P57016 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lad1P57016 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lad1P57016 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lad1P57016 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lad1P57016 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lad1P57016 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lad1P57016 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lad1P57016 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lad1P57016 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lad1P57016 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lad1P57016 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lad1P57016 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lad1P57016 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lad1P57016 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lad1P57016 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lad1P57016 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lad1P57016 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lad1P57016 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lad1P57016 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lad1P57016 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lad1P57016 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lad1P57016 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lad1P57016 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lad1P57016 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lad1P57016 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lad1P57016 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lad1P57016 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lad1P57016 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lad1P57016 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lad1P57016 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lad1P57016 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lad1P57016 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lad1P57016 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lad1P57016 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lad1P57016 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lad1P57016 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lad1P57016 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lad1P57016 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lad1P57016 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lad1P57016 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lad1P57016 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lad1P57016 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lad1P57016 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lad1P57016 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lad1P57016 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lad1P57016 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lad1P57016 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lad1P57016 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lad1P57016 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lad1P57016 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lad1P57016 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lad1P57016 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lad1P57016 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lad1P57016 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lad1P57016 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lad1P57016 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lad1P57016 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lad1P57016 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lad1P57016 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lad1P57016 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lad1P57016 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lad1P57016 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lad1P57016 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lad1P57016 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lad1P57016 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lad1P57016 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lad1P57016 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lad1P57016 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms