Protein–RNA interactions for Protein: P56567

Csta, Cystatin-A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CstaP56567 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
CstaP56567 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,72■■■□□ 2,19
CstaP56567 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
CstaP56567 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
CstaP56567 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
CstaP56567 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
CstaP56567 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,62■■■□□ 2,17
CstaP56567 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
CstaP56567 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
CstaP56567 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,57■■■□□ 2,16
CstaP56567 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
CstaP56567 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
CstaP56567 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,53■■■□□ 2,16
CstaP56567 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
CstaP56567 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
CstaP56567 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
CstaP56567 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
CstaP56567 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
CstaP56567 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
CstaP56567 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
CstaP56567 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
CstaP56567 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
CstaP56567 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
CstaP56567 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
CstaP56567 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
CstaP56567 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
CstaP56567 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
CstaP56567 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
CstaP56567 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
CstaP56567 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
CstaP56567 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
CstaP56567 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,24■■■□□ 2,11
CstaP56567 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
CstaP56567 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,18■■■□□ 2,1
CstaP56567 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
CstaP56567 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
CstaP56567 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,15■■■□□ 2,1
CstaP56567 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
CstaP56567 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
CstaP56567 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
CstaP56567 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
CstaP56567 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
CstaP56567 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
CstaP56567 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,91■■■□□ 2,06
CstaP56567 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
CstaP56567 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,88■■■□□ 2,05
CstaP56567 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
CstaP56567 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,87■■■□□ 2,05
CstaP56567 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
CstaP56567 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
CstaP56567 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
CstaP56567 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
CstaP56567 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,83■■■□□ 2,05
CstaP56567 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
CstaP56567 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
CstaP56567 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
CstaP56567 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
CstaP56567 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,71■■■□□ 2,03
CstaP56567 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
CstaP56567 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
CstaP56567 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,67■■■□□ 2,02
CstaP56567 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,66■■■□□ 2,02
CstaP56567 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
CstaP56567 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27,65■■■□□ 2,02
CstaP56567 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,64■■■□□ 2,02
CstaP56567 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
CstaP56567 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
CstaP56567 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
CstaP56567 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
CstaP56567 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
CstaP56567 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
CstaP56567 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
CstaP56567 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
CstaP56567 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
CstaP56567 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
CstaP56567 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
CstaP56567 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,45■■□□□ 1,99
CstaP56567 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
CstaP56567 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
CstaP56567 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
CstaP56567 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
CstaP56567 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
CstaP56567 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
CstaP56567 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,33■■□□□ 1,97
CstaP56567 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
CstaP56567 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,33■■□□□ 1,97
CstaP56567 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
CstaP56567 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
CstaP56567 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
CstaP56567 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
CstaP56567 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
CstaP56567 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,27■■□□□ 1,96
CstaP56567 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
CstaP56567 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
CstaP56567 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
CstaP56567 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
CstaP56567 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
CstaP56567 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
CstaP56567 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,19■■□□□ 1,94
CstaP56567 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms