Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
CckbrP56481 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
CckbrP56481 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
CckbrP56481 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25,51■■□□□ 1,67
CckbrP56481 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
CckbrP56481 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25,48■■□□□ 1,67
CckbrP56481 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
CckbrP56481 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
CckbrP56481 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
CckbrP56481 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25,44■■□□□ 1,66
CckbrP56481 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
CckbrP56481 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
CckbrP56481 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,42■■□□□ 1,66
CckbrP56481 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
CckbrP56481 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
CckbrP56481 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
CckbrP56481 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
CckbrP56481 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
CckbrP56481 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
CckbrP56481 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
CckbrP56481 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
CckbrP56481 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
CckbrP56481 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
CckbrP56481 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
CckbrP56481 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
CckbrP56481 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25,12■■□□□ 1,61
CckbrP56481 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
CckbrP56481 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
CckbrP56481 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
CckbrP56481 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
CckbrP56481 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
CckbrP56481 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25,09■■□□□ 1,61
CckbrP56481 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
CckbrP56481 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,03■■□□□ 1,6
CckbrP56481 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
CckbrP56481 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
CckbrP56481 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
CckbrP56481 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
CckbrP56481 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
CckbrP56481 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
CckbrP56481 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
CckbrP56481 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,93■■□□□ 1,58
CckbrP56481 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
CckbrP56481 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24,88■■□□□ 1,57
CckbrP56481 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
CckbrP56481 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
CckbrP56481 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
CckbrP56481 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
CckbrP56481 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
CckbrP56481 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,79■■□□□ 1,56
CckbrP56481 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
CckbrP56481 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,78■■□□□ 1,56
CckbrP56481 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
CckbrP56481 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24,77■■□□□ 1,56
CckbrP56481 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,77■■□□□ 1,56
CckbrP56481 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
CckbrP56481 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
CckbrP56481 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
CckbrP56481 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
CckbrP56481 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
CckbrP56481 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24,73■■□□□ 1,55
CckbrP56481 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
CckbrP56481 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
CckbrP56481 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,72■■□□□ 1,55
CckbrP56481 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
CckbrP56481 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
CckbrP56481 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
CckbrP56481 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
CckbrP56481 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
CckbrP56481 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
CckbrP56481 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
CckbrP56481 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
CckbrP56481 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
CckbrP56481 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
CckbrP56481 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,55■■□□□ 1,52
CckbrP56481 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,55■■□□□ 1,52
CckbrP56481 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
CckbrP56481 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
CckbrP56481 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,49■■□□□ 1,51
CckbrP56481 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
CckbrP56481 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
CckbrP56481 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,46■■□□□ 1,51
CckbrP56481 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,45■■□□□ 1,51
CckbrP56481 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
CckbrP56481 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
CckbrP56481 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
CckbrP56481 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
CckbrP56481 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,31■■□□□ 1,48
CckbrP56481 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
CckbrP56481 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
CckbrP56481 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
CckbrP56481 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
CckbrP56481 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
CckbrP56481 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
CckbrP56481 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
CckbrP56481 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
CckbrP56481 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
CckbrP56481 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
CckbrP56481 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
CckbrP56481 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35,5 ms