Protein–RNA interactions for Protein: P55850

Dsc3, Desmocollin-3, mousemouse

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc3P55850 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Dsc3P55850 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Dsc3P55850 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,78■■■□□ 2,2
Dsc3P55850 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Dsc3P55850 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
Dsc3P55850 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Dsc3P55850 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Dsc3P55850 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Dsc3P55850 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Dsc3P55850 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Dsc3P55850 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Dsc3P55850 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Dsc3P55850 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Dsc3P55850 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Dsc3P55850 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Dsc3P55850 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Dsc3P55850 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Dsc3P55850 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Dsc3P55850 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Dsc3P55850 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Dsc3P55850 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Dsc3P55850 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Dsc3P55850 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Dsc3P55850 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,21■■■□□ 2,11
Dsc3P55850 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Dsc3P55850 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Dsc3P55850 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Dsc3P55850 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Dsc3P55850 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Dsc3P55850 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Dsc3P55850 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Dsc3P55850 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Dsc3P55850 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Dsc3P55850 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Dsc3P55850 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Dsc3P55850 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Dsc3P55850 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Dsc3P55850 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Dsc3P55850 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Dsc3P55850 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Dsc3P55850 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Dsc3P55850 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Dsc3P55850 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Dsc3P55850 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27,89■■■□□ 2,06
Dsc3P55850 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Dsc3P55850 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27,88■■■□□ 2,05
Dsc3P55850 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Dsc3P55850 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Dsc3P55850 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Dsc3P55850 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Dsc3P55850 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Dsc3P55850 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Dsc3P55850 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Dsc3P55850 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Dsc3P55850 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Dsc3P55850 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Dsc3P55850 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Dsc3P55850 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Dsc3P55850 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
Dsc3P55850 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Dsc3P55850 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27,62■■■□□ 2,01
Dsc3P55850 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Dsc3P55850 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Dsc3P55850 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Dsc3P55850 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Dsc3P55850 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Dsc3P55850 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Dsc3P55850 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Dsc3P55850 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Dsc3P55850 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Dsc3P55850 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Dsc3P55850 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Dsc3P55850 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Dsc3P55850 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Dsc3P55850 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Dsc3P55850 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Dsc3P55850 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Dsc3P55850 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Dsc3P55850 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Dsc3P55850 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,35■■□□□ 1,97
Dsc3P55850 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Dsc3P55850 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Dsc3P55850 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27,3■■□□□ 1,96
Dsc3P55850 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Dsc3P55850 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Dsc3P55850 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Dsc3P55850 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27,27■■□□□ 1,96
Dsc3P55850 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
Dsc3P55850 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Dsc3P55850 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Dsc3P55850 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Dsc3P55850 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Dsc3P55850 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Dsc3P55850 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Dsc3P55850 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Dsc3P55850 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Dsc3P55850 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Dsc3P55850 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Dsc3P55850 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Dsc3P55850 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms