Protein–RNA interactions for Protein: P55292

Dsc2, Desmocollin-2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc2P55292 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dsc2P55292 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Dsc2P55292 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dsc2P55292 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dsc2P55292 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dsc2P55292 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Dsc2P55292 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dsc2P55292 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dsc2P55292 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dsc2P55292 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dsc2P55292 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dsc2P55292 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dsc2P55292 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dsc2P55292 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dsc2P55292 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Dsc2P55292 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dsc2P55292 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dsc2P55292 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dsc2P55292 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dsc2P55292 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dsc2P55292 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dsc2P55292 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Dsc2P55292 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dsc2P55292 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Dsc2P55292 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dsc2P55292 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dsc2P55292 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Dsc2P55292 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Dsc2P55292 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Dsc2P55292 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dsc2P55292 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dsc2P55292 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dsc2P55292 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dsc2P55292 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dsc2P55292 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dsc2P55292 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dsc2P55292 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Dsc2P55292 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dsc2P55292 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dsc2P55292 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Dsc2P55292 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dsc2P55292 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dsc2P55292 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dsc2P55292 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dsc2P55292 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dsc2P55292 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dsc2P55292 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dsc2P55292 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dsc2P55292 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dsc2P55292 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dsc2P55292 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dsc2P55292 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dsc2P55292 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dsc2P55292 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Dsc2P55292 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dsc2P55292 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dsc2P55292 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dsc2P55292 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dsc2P55292 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dsc2P55292 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dsc2P55292 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dsc2P55292 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Dsc2P55292 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Dsc2P55292 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dsc2P55292 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Dsc2P55292 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dsc2P55292 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dsc2P55292 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dsc2P55292 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dsc2P55292 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Dsc2P55292 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dsc2P55292 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dsc2P55292 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Dsc2P55292 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dsc2P55292 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dsc2P55292 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dsc2P55292 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dsc2P55292 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dsc2P55292 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Dsc2P55292 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Dsc2P55292 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dsc2P55292 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Dsc2P55292 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Dsc2P55292 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dsc2P55292 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Dsc2P55292 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Dsc2P55292 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Dsc2P55292 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Dsc2P55292 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dsc2P55292 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dsc2P55292 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dsc2P55292 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Dsc2P55292 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dsc2P55292 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dsc2P55292 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dsc2P55292 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Dsc2P55292 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Dsc2P55292 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Dsc2P55292 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dsc2P55292 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms