Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Sh3bp1P55194 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Sh3bp1P55194 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Sh3bp1P55194 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Sh3bp1P55194 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Sh3bp1P55194 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Sh3bp1P55194 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Sh3bp1P55194 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,63■■■□□ 2,33
Sh3bp1P55194 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Sh3bp1P55194 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Sh3bp1P55194 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Sh3bp1P55194 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Sh3bp1P55194 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Sh3bp1P55194 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,54■■■□□ 2,32
Sh3bp1P55194 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Sh3bp1P55194 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Sh3bp1P55194 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Sh3bp1P55194 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Sh3bp1P55194 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Sh3bp1P55194 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Sh3bp1P55194 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Sh3bp1P55194 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Sh3bp1P55194 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Sh3bp1P55194 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Sh3bp1P55194 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Sh3bp1P55194 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Sh3bp1P55194 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Sh3bp1P55194 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Sh3bp1P55194 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,26■■■□□ 2,27
Sh3bp1P55194 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Sh3bp1P55194 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Sh3bp1P55194 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Sh3bp1P55194 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Sh3bp1P55194 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Sh3bp1P55194 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Sh3bp1P55194 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Sh3bp1P55194 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Sh3bp1P55194 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Sh3bp1P55194 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Sh3bp1P55194 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Sh3bp1P55194 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Sh3bp1P55194 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Sh3bp1P55194 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Sh3bp1P55194 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Sh3bp1P55194 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Sh3bp1P55194 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Sh3bp1P55194 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Sh3bp1P55194 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Sh3bp1P55194 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Sh3bp1P55194 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Sh3bp1P55194 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Sh3bp1P55194 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Sh3bp1P55194 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Sh3bp1P55194 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Sh3bp1P55194 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Sh3bp1P55194 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Sh3bp1P55194 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Sh3bp1P55194 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Sh3bp1P55194 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Sh3bp1P55194 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Sh3bp1P55194 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Sh3bp1P55194 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Sh3bp1P55194 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Sh3bp1P55194 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Sh3bp1P55194 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Sh3bp1P55194 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Sh3bp1P55194 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Sh3bp1P55194 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Sh3bp1P55194 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28,84■■■□□ 2,21
Sh3bp1P55194 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Sh3bp1P55194 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Sh3bp1P55194 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,79■■■□□ 2,2
Sh3bp1P55194 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Sh3bp1P55194 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Sh3bp1P55194 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Sh3bp1P55194 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Sh3bp1P55194 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Sh3bp1P55194 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Sh3bp1P55194 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Sh3bp1P55194 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Sh3bp1P55194 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Sh3bp1P55194 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Sh3bp1P55194 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Sh3bp1P55194 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Sh3bp1P55194 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Sh3bp1P55194 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Sh3bp1P55194 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Sh3bp1P55194 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Sh3bp1P55194 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Sh3bp1P55194 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Sh3bp1P55194 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Sh3bp1P55194 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Sh3bp1P55194 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Sh3bp1P55194 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Sh3bp1P55194 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Sh3bp1P55194 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Sh3bp1P55194 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Sh3bp1P55194 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Sh3bp1P55194 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Sh3bp1P55194 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms