Protein–RNA interactions for Protein: P54320

Eln, Elastin, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElnP54320 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ElnP54320 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ElnP54320 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ElnP54320 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ElnP54320 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ElnP54320 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ElnP54320 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ElnP54320 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ElnP54320 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ElnP54320 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ElnP54320 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ElnP54320 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ElnP54320 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ElnP54320 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ElnP54320 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ElnP54320 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ElnP54320 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ElnP54320 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ElnP54320 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ElnP54320 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ElnP54320 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ElnP54320 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ElnP54320 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ElnP54320 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ElnP54320 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ElnP54320 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ElnP54320 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ElnP54320 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ElnP54320 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ElnP54320 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ElnP54320 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ElnP54320 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ElnP54320 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ElnP54320 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ElnP54320 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ElnP54320 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ElnP54320 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ElnP54320 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ElnP54320 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ElnP54320 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ElnP54320 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ElnP54320 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ElnP54320 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ElnP54320 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ElnP54320 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ElnP54320 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ElnP54320 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ElnP54320 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ElnP54320 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ElnP54320 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ElnP54320 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ElnP54320 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ElnP54320 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ElnP54320 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ElnP54320 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ElnP54320 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ElnP54320 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ElnP54320 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ElnP54320 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ElnP54320 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ElnP54320 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ElnP54320 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ElnP54320 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ElnP54320 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ElnP54320 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ElnP54320 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ElnP54320 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ElnP54320 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ElnP54320 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ElnP54320 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ElnP54320 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ElnP54320 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ElnP54320 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ElnP54320 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ElnP54320 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ElnP54320 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ElnP54320 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ElnP54320 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ElnP54320 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ElnP54320 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ElnP54320 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ElnP54320 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ElnP54320 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ElnP54320 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ElnP54320 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ElnP54320 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ElnP54320 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ElnP54320 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ElnP54320 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ElnP54320 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ElnP54320 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ElnP54320 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ElnP54320 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ElnP54320 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ElnP54320 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ElnP54320 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ElnP54320 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ElnP54320 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ElnP54320 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ElnP54320 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms