Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Cacnb3P54285 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Cacnb3P54285 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cacnb3P54285 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cacnb3P54285 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Cacnb3P54285 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cacnb3P54285 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cacnb3P54285 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cacnb3P54285 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cacnb3P54285 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Cacnb3P54285 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cacnb3P54285 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cacnb3P54285 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cacnb3P54285 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cacnb3P54285 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cacnb3P54285 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cacnb3P54285 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Cacnb3P54285 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Cacnb3P54285 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Cacnb3P54285 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Cacnb3P54285 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Cacnb3P54285 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Cacnb3P54285 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Cacnb3P54285 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Cacnb3P54285 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Cacnb3P54285 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Cacnb3P54285 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Cacnb3P54285 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cacnb3P54285 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Cacnb3P54285 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Cacnb3P54285 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Cacnb3P54285 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Cacnb3P54285 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Cacnb3P54285 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cacnb3P54285 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Cacnb3P54285 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cacnb3P54285 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Cacnb3P54285 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Cacnb3P54285 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Cacnb3P54285 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Cacnb3P54285 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Cacnb3P54285 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cacnb3P54285 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Cacnb3P54285 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Cacnb3P54285 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cacnb3P54285 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Cacnb3P54285 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Cacnb3P54285 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Cacnb3P54285 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Cacnb3P54285 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Cacnb3P54285 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cacnb3P54285 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cacnb3P54285 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cacnb3P54285 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cacnb3P54285 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Cacnb3P54285 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cacnb3P54285 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cacnb3P54285 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Cacnb3P54285 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Cacnb3P54285 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Cacnb3P54285 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cacnb3P54285 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Cacnb3P54285 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Cacnb3P54285 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cacnb3P54285 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Cacnb3P54285 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Cacnb3P54285 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Cacnb3P54285 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Cacnb3P54285 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Cacnb3P54285 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cacnb3P54285 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Cacnb3P54285 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Cacnb3P54285 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Cacnb3P54285 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Cacnb3P54285 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cacnb3P54285 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Cacnb3P54285 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cacnb3P54285 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cacnb3P54285 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Cacnb3P54285 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cacnb3P54285 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cacnb3P54285 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cacnb3P54285 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Cacnb3P54285 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Cacnb3P54285 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cacnb3P54285 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cacnb3P54285 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cacnb3P54285 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Cacnb3P54285 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Cacnb3P54285 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cacnb3P54285 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Cacnb3P54285 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cacnb3P54285 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Cacnb3P54285 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Cacnb3P54285 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cacnb3P54285 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Cacnb3P54285 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Cacnb3P54285 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cacnb3P54285 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cacnb3P54285 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms