Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Atxn1P54254 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atxn1P54254 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atxn1P54254 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Atxn1P54254 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atxn1P54254 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atxn1P54254 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Atxn1P54254 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atxn1P54254 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atxn1P54254 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atxn1P54254 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atxn1P54254 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atxn1P54254 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atxn1P54254 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atxn1P54254 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atxn1P54254 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atxn1P54254 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Atxn1P54254 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atxn1P54254 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atxn1P54254 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atxn1P54254 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atxn1P54254 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atxn1P54254 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Atxn1P54254 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atxn1P54254 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atxn1P54254 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atxn1P54254 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atxn1P54254 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atxn1P54254 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atxn1P54254 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atxn1P54254 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atxn1P54254 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atxn1P54254 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atxn1P54254 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atxn1P54254 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atxn1P54254 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atxn1P54254 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atxn1P54254 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Atxn1P54254 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atxn1P54254 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atxn1P54254 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atxn1P54254 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atxn1P54254 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atxn1P54254 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atxn1P54254 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atxn1P54254 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atxn1P54254 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atxn1P54254 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Atxn1P54254 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atxn1P54254 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atxn1P54254 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atxn1P54254 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atxn1P54254 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atxn1P54254 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Atxn1P54254 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atxn1P54254 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atxn1P54254 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atxn1P54254 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Atxn1P54254 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atxn1P54254 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atxn1P54254 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atxn1P54254 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atxn1P54254 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atxn1P54254 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atxn1P54254 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atxn1P54254 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atxn1P54254 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atxn1P54254 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atxn1P54254 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atxn1P54254 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atxn1P54254 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atxn1P54254 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atxn1P54254 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atxn1P54254 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Atxn1P54254 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Atxn1P54254 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Atxn1P54254 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Atxn1P54254 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Atxn1P54254 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Atxn1P54254 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Atxn1P54254 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Atxn1P54254 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Atxn1P54254 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Atxn1P54254 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atxn1P54254 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atxn1P54254 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atxn1P54254 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atxn1P54254 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atxn1P54254 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atxn1P54254 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atxn1P54254 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Atxn1P54254 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atxn1P54254 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Atxn1P54254 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atxn1P54254 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Atxn1P54254 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atxn1P54254 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atxn1P54254 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Atxn1P54254 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atxn1P54254 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.7 ms