Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PolgP54099 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PolgP54099 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PolgP54099 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PolgP54099 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PolgP54099 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PolgP54099 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PolgP54099 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PolgP54099 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PolgP54099 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PolgP54099 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PolgP54099 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PolgP54099 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PolgP54099 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PolgP54099 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PolgP54099 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PolgP54099 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PolgP54099 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PolgP54099 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PolgP54099 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PolgP54099 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PolgP54099 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PolgP54099 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PolgP54099 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PolgP54099 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PolgP54099 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PolgP54099 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PolgP54099 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PolgP54099 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PolgP54099 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PolgP54099 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PolgP54099 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PolgP54099 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PolgP54099 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PolgP54099 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PolgP54099 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PolgP54099 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PolgP54099 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PolgP54099 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PolgP54099 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PolgP54099 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PolgP54099 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PolgP54099 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PolgP54099 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PolgP54099 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PolgP54099 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PolgP54099 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PolgP54099 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PolgP54099 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PolgP54099 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PolgP54099 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PolgP54099 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PolgP54099 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PolgP54099 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PolgP54099 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PolgP54099 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PolgP54099 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PolgP54099 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PolgP54099 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PolgP54099 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PolgP54099 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PolgP54099 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PolgP54099 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PolgP54099 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PolgP54099 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PolgP54099 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PolgP54099 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PolgP54099 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PolgP54099 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PolgP54099 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PolgP54099 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PolgP54099 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PolgP54099 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PolgP54099 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PolgP54099 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PolgP54099 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PolgP54099 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PolgP54099 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PolgP54099 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PolgP54099 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PolgP54099 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PolgP54099 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PolgP54099 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PolgP54099 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PolgP54099 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PolgP54099 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PolgP54099 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PolgP54099 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PolgP54099 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PolgP54099 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PolgP54099 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PolgP54099 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PolgP54099 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PolgP54099 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PolgP54099 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PolgP54099 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PolgP54099 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PolgP54099 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PolgP54099 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PolgP54099 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms