Protein–RNA interactions for Protein: P52825

Cpt2, Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpt2P52825 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpt2P52825 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cpt2P52825 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cpt2P52825 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cpt2P52825 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cpt2P52825 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cpt2P52825 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpt2P52825 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cpt2P52825 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cpt2P52825 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cpt2P52825 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cpt2P52825 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cpt2P52825 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cpt2P52825 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cpt2P52825 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cpt2P52825 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cpt2P52825 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cpt2P52825 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpt2P52825 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpt2P52825 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cpt2P52825 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpt2P52825 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpt2P52825 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cpt2P52825 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpt2P52825 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cpt2P52825 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cpt2P52825 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cpt2P52825 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cpt2P52825 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cpt2P52825 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpt2P52825 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpt2P52825 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpt2P52825 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpt2P52825 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpt2P52825 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpt2P52825 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpt2P52825 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpt2P52825 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpt2P52825 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpt2P52825 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpt2P52825 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpt2P52825 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpt2P52825 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpt2P52825 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpt2P52825 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpt2P52825 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpt2P52825 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpt2P52825 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpt2P52825 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cpt2P52825 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cpt2P52825 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpt2P52825 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpt2P52825 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpt2P52825 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpt2P52825 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpt2P52825 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpt2P52825 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cpt2P52825 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpt2P52825 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpt2P52825 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cpt2P52825 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cpt2P52825 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cpt2P52825 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpt2P52825 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpt2P52825 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpt2P52825 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpt2P52825 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpt2P52825 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cpt2P52825 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cpt2P52825 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpt2P52825 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpt2P52825 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpt2P52825 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpt2P52825 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpt2P52825 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cpt2P52825 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpt2P52825 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpt2P52825 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpt2P52825 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpt2P52825 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpt2P52825 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpt2P52825 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpt2P52825 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpt2P52825 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cpt2P52825 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cpt2P52825 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpt2P52825 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cpt2P52825 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpt2P52825 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cpt2P52825 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cpt2P52825 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cpt2P52825 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cpt2P52825 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpt2P52825 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpt2P52825 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpt2P52825 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpt2P52825 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpt2P52825 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cpt2P52825 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpt2P52825 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms