Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tnnt2P50752 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Tnnt2P50752 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tnnt2P50752 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tnnt2P50752 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tnnt2P50752 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Tnnt2P50752 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tnnt2P50752 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tnnt2P50752 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tnnt2P50752 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tnnt2P50752 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tnnt2P50752 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Tnnt2P50752 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tnnt2P50752 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Tnnt2P50752 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tnnt2P50752 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tnnt2P50752 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Tnnt2P50752 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tnnt2P50752 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tnnt2P50752 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tnnt2P50752 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tnnt2P50752 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tnnt2P50752 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tnnt2P50752 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tnnt2P50752 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Tnnt2P50752 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Tnnt2P50752 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tnnt2P50752 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tnnt2P50752 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tnnt2P50752 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnnt2P50752 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tnnt2P50752 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tnnt2P50752 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnnt2P50752 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tnnt2P50752 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tnnt2P50752 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tnnt2P50752 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Tnnt2P50752 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Tnnt2P50752 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnnt2P50752 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnnt2P50752 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tnnt2P50752 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tnnt2P50752 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tnnt2P50752 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tnnt2P50752 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tnnt2P50752 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tnnt2P50752 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tnnt2P50752 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tnnt2P50752 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnnt2P50752 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnnt2P50752 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tnnt2P50752 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnnt2P50752 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tnnt2P50752 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tnnt2P50752 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tnnt2P50752 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Tnnt2P50752 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tnnt2P50752 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tnnt2P50752 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnnt2P50752 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnnt2P50752 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnnt2P50752 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnnt2P50752 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tnnt2P50752 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Tnnt2P50752 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnnt2P50752 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tnnt2P50752 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tnnt2P50752 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tnnt2P50752 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tnnt2P50752 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tnnt2P50752 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tnnt2P50752 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tnnt2P50752 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tnnt2P50752 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Tnnt2P50752 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tnnt2P50752 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tnnt2P50752 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tnnt2P50752 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnnt2P50752 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnnt2P50752 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tnnt2P50752 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tnnt2P50752 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Tnnt2P50752 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnnt2P50752 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tnnt2P50752 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnnt2P50752 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnnt2P50752 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnnt2P50752 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnnt2P50752 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnnt2P50752 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tnnt2P50752 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tnnt2P50752 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tnnt2P50752 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnnt2P50752 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tnnt2P50752 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnnt2P50752 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnnt2P50752 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnnt2P50752 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnnt2P50752 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tnnt2P50752 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms