Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx2-1P50220 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx2-1P50220 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-1P50220 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx2-1P50220 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx2-1P50220 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx2-1P50220 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx2-1P50220 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx2-1P50220 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx2-1P50220 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx2-1P50220 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-1P50220 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-1P50220 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-1P50220 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-1P50220 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-1P50220 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-1P50220 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-1P50220 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx2-1P50220 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-1P50220 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-1P50220 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nkx2-1P50220 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-1P50220 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nkx2-1P50220 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nkx2-1P50220 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nkx2-1P50220 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nkx2-1P50220 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nkx2-1P50220 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nkx2-1P50220 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nkx2-1P50220 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nkx2-1P50220 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nkx2-1P50220 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nkx2-1P50220 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nkx2-1P50220 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nkx2-1P50220 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-1P50220 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Nkx2-1P50220 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nkx2-1P50220 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx2-1P50220 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx2-1P50220 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx2-1P50220 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx2-1P50220 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx2-1P50220 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx2-1P50220 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx2-1P50220 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx2-1P50220 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx2-1P50220 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx2-1P50220 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx2-1P50220 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx2-1P50220 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx2-1P50220 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nkx2-1P50220 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nkx2-1P50220 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Nkx2-1P50220 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx2-1P50220 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nkx2-1P50220 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nkx2-1P50220 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Nkx2-1P50220 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx2-1P50220 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx2-1P50220 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nkx2-1P50220 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx2-1P50220 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nkx2-1P50220 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nkx2-1P50220 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nkx2-1P50220 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nkx2-1P50220 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-1P50220 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-1P50220 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-1P50220 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-1P50220 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-1P50220 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx2-1P50220 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nkx2-1P50220 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx2-1P50220 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx2-1P50220 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx2-1P50220 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx2-1P50220 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx2-1P50220 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nkx2-1P50220 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nkx2-1P50220 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx2-1P50220 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx2-1P50220 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx2-1P50220 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nkx2-1P50220 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nkx2-1P50220 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nkx2-1P50220 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nkx2-1P50220 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nkx2-1P50220 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nkx2-1P50220 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-1P50220 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-1P50220 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-1P50220 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-1P50220 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-1P50220 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nkx2-1P50220 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx2-1P50220 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nkx2-1P50220 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx2-1P50220 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx2-1P50220 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nkx2-1P50220 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms