Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,65■■■□□ 2,34
CitP49025 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
CitP49025 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
CitP49025 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
CitP49025 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
CitP49025 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
CitP49025 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
CitP49025 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
CitP49025 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
CitP49025 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
CitP49025 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
CitP49025 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
CitP49025 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,36■■■□□ 2,29
CitP49025 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
CitP49025 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
CitP49025 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
CitP49025 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,33■■■□□ 2,29
CitP49025 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
CitP49025 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,32■■■□□ 2,28
CitP49025 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,3■■■□□ 2,28
CitP49025 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
CitP49025 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
CitP49025 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
CitP49025 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
CitP49025 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
CitP49025 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
CitP49025 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
CitP49025 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,25
CitP49025 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,08■■■□□ 2,25
CitP49025 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
CitP49025 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
CitP49025 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
CitP49025 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
CitP49025 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
CitP49025 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,92■■■□□ 2,22
CitP49025 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
CitP49025 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
CitP49025 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,89■■■□□ 2,21
CitP49025 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
CitP49025 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
CitP49025 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
CitP49025 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
CitP49025 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
CitP49025 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,75■■■□□ 2,19
CitP49025 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
CitP49025 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,71■■■□□ 2,19
CitP49025 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
CitP49025 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
CitP49025 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
CitP49025 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
CitP49025 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
CitP49025 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
CitP49025 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,67■■■□□ 2,18
CitP49025 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
CitP49025 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,63■■■□□ 2,17
CitP49025 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,58■■■□□ 2,17
CitP49025 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
CitP49025 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
CitP49025 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,55■■■□□ 2,16
CitP49025 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
CitP49025 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
CitP49025 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
CitP49025 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
CitP49025 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
CitP49025 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
CitP49025 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
CitP49025 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
CitP49025 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
CitP49025 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
CitP49025 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
CitP49025 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
CitP49025 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
CitP49025 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
CitP49025 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
CitP49025 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
CitP49025 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
CitP49025 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
CitP49025 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
CitP49025 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
CitP49025 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
CitP49025 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
CitP49025 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
CitP49025 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
CitP49025 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
CitP49025 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,14■■■□□ 2,09
CitP49025 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
CitP49025 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
CitP49025 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
CitP49025 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,08■■■□□ 2,09
CitP49025 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
CitP49025 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
CitP49025 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
CitP49025 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
CitP49025 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
CitP49025 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,08
CitP49025 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
CitP49025 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
CitP49025 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
CitP49025 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,99■■■□□ 2,07
CitP49025 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,5 ms